23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2720 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2720  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.025893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4353  hypothetical protein  42.42 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0897  hypothetical protein  39.21 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0597  hypothetical protein  32.02 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0455  hypothetical protein  33.93 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184475  normal  0.579054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4644  hypothetical protein  33.5 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6172  hypothetical protein  28.38 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0339  hypothetical protein  31.56 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0295  hypothetical protein  32.3 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8249  hypothetical protein  28.87 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6370  hypothetical protein  24.05 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2023  hypothetical protein  25.12 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6825  hypothetical protein  22.05 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37680  hypothetical protein  23.58 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0858561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3896  hypothetical protein  27.97 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3946  hypothetical protein  26.21 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.125264 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4985  hypothetical protein  27.32 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0945  hypothetical protein  25.64 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.085357  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3730  hypothetical protein  28.12 
 
 		 366 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0126  hypothetical protein  27.01 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5596  hypothetical protein  25.21 
 
 		 439 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00840265  normal  0.0208396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3546  hypothetical protein  28.28 
 
 		 275 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.341161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2361  hypothetical protein  29.75 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0463376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>