20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0945 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0945  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  758    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.085357  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3896  hypothetical protein  59.54 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3730  hypothetical protein  60.96 
 
 		 366 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  49.29 
 
 		 583 aa  216  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6172  hypothetical protein  36.55 
 
 		 255 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3393  hypothetical protein  40.94 
 
 		 193 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8249  hypothetical protein  32.54 
 
 		 253 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0455  hypothetical protein  32.64 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184475  normal  0.579054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6370  hypothetical protein  27.09 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2023  hypothetical protein  27.27 
 
 		 259 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2361  hypothetical protein  29.34 
 
 		 247 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0463376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0897  hypothetical protein  32.45 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0597  hypothetical protein  24.79 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0295  hypothetical protein  28.63 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0339  hypothetical protein  28.28 
 
 		 262 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4644  hypothetical protein  40 
 
 		 229 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6825  hypothetical protein  29.17 
 
 		 268 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37680  hypothetical protein  30.26 
 
 		 270 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0858561 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2720  hypothetical protein  24.55 
 
 		 229 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.025893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0849  hypothetical protein  28.37 
 
 		 230 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>