17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6370 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6370  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0339  hypothetical protein  34.07 
 
 		 262 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0295  hypothetical protein  35.4 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6172  hypothetical protein  25.21 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0945  hypothetical protein  27.78 
 
 		 389 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.085357  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4644  hypothetical protein  26.58 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5596  hypothetical protein  27.07 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00840265  normal  0.0208396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0597  hypothetical protein  24.79 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0897  hypothetical protein  26.46 
 
 		 226 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4985  hypothetical protein  24.76 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3730  hypothetical protein  27.8 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2720  hypothetical protein  24.11 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.025893  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3896  hypothetical protein  25.29 
 
 		 405 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0455  hypothetical protein  25.22 
 
 		 226 aa  53.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184475  normal  0.579054 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37680  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0858561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8249  hypothetical protein  29.55 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2023  hypothetical protein  27.11 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>