21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3896 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3896  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  796    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3730  hypothetical protein  65.56 
 
 		 366 aa  310  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5596  hypothetical protein  69.7 
 
 		 439 aa  309  6.999999999999999e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00840265  normal  0.0208396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0945  hypothetical protein  59.54 
 
 		 389 aa  282  7.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.085357  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 583 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3393  hypothetical protein  46.15 
 
 		 193 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6172  hypothetical protein  33.07 
 
 		 255 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0455  hypothetical protein  30.96 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184475  normal  0.579054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8249  hypothetical protein  38.24 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0339  hypothetical protein  32.13 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2720  hypothetical protein  27.23 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.025893  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6370  hypothetical protein  24.81 
 
 		 248 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2023  hypothetical protein  26.94 
 
 		 259 aa  54.3  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0295  hypothetical protein  29.27 
 
 		 263 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4644  hypothetical protein  38.46 
 
 		 229 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2361  hypothetical protein  31.43 
 
 		 247 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0463376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6825  hypothetical protein  28.21 
 
 		 268 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0597  hypothetical protein  25.83 
 
 		 232 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0897  hypothetical protein  27.5 
 
 		 226 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3946  hypothetical protein  25.39 
 
 		 237 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.125264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37680  hypothetical protein  28 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0858561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>