209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1992 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1992  transposase IS4 family protein  100 
 
 
297 aa  585  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4410  hypothetical protein  56.91 
 
 
304 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0177998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0220  transposase, IS4  24.17 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0248  transposase, IS4  24.17 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0387  transposase, IS4  24.17 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00245948  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0967  transposase, IS4  24.17 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1660  transposase, IS4  24.17 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1666  transposase, IS4  24.17 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2323  transposase, IS4  24.17 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0359  IS4 family transposase  21.99 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.441685  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0407  IS4 family transposase  21.99 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547418 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0414  IS4 family transposase  21.99 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0545  IS4 family transposase  21.99 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0933  IS4 family transposase  21.99 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.148656  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0944  IS4 family transposase  21.99 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1427  IS4 family transposase  21.99 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.716221  normal  0.315451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1490  IS4 family transposase  21.99 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.495373 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1748  IS4 family transposase  21.99 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.7477  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2086  IS4 family transposase  21.99 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2483  transposase, IS4  22.68 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6216  hypothetical protein  55.42 
 
 
108 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0165  hypothetical protein  25.36 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1387  transposase IS4 family protein  27.83 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0573  IS4 family transposase  29.3 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000020432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1788  IS4 family transposase  29.3 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2486  IS4 family transposase  29.3 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2528  IS4 family transposase  29.3 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3039  IS4 family transposase  29.3 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0904  hypothetical protein  27.69 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.205856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2488  putative transposase  29.69 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2070  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2727  transposase IS4 family protein  26.12 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1842  transposase IS4 family protein  26.12 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3267  transposase IS4 family protein  26.12 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0878  transposase IS4 family protein  26.12 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2283  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3571  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0798  ISPg3, transposase  25.48 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1032  ISPg3, transposase  25.48 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104806 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1070  hypothetical protein  27.31 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0366  hypothetical protein  27.31 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15109 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0128  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0134  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0261  ISPg3, transposase  25.1 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1225  hypothetical protein  27.44 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00515958 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1162  hypothetical protein  27.44 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.452427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1975  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal  0.187697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2860  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3563  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3128  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.205548  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3162  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0194  ISPg3, transposase  25.1 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.818516 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0261  hypothetical protein  26.92 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D34  transposase  24.52 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0159286  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D36  transposase  25.42 
 
 
284 aa  65.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0652132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2950  transposase IS4 family protein  25.78 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000202826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1807  transposase IS4 family protein  25.78 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0250  transposase IS4 family protein  25.39 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3325  transposase IS4 family protein  25.78 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0303037  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0286  transposase  24.36 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0205191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0350  transposase  23.92 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.676447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1925  transposase IS4 family protein  24.51 
 
 
292 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1162  transposase  24.43 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1346  transposase  24.52 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000526235  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2768  transposase IS4 family protein  25.78 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0213708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2012  transposase IS4 family protein  25.39 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2666  transposase IS4 family protein  25.39 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000825775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3382  transposase IS4 family protein  25.78 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0393001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3189  transposase IS4 family protein  25.39 
 
 
292 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000374616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1672  transposase IS4 family protein  25.39 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0376  transposase  23.92 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0527454  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0919  transposase  24.52 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00272522  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3432  transposase IS4 family protein  25.78 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580659  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1227  transposase  23.92 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00543475  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2062  transposase IS4 family protein  25.78 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000149012  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2055  transposase IS4 family protein  25.78 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.862347  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1989  transposase  23.92 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.588662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3335  transposase IS4 family protein  25.78 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2313  transposase  24.14 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.101441  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2360  transposase  24.14 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.398217  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2428  transposase  24.14 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0476  transposase  24.14 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0801  transposase  24.14 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000583007  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0069  transposase, IS4 family protein  25.48 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0675  transposase  24.14 
 
 
296 aa  62.8  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10833  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0679  transposase  24.14 
 
 
296 aa  63.2  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00272522  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0943  transposase  24.14 
 
 
296 aa  62.8  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000548004  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1516  transposase  24.14 
 
 
296 aa  63.2  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000441669  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1738  transposase  24.14 
 
 
296 aa  63.2  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0265447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2035  transposase  24.14 
 
 
296 aa  63.2  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0151047  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2203  transposase  24.14 
 
 
296 aa  63.2  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00928049  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2462  transposase  24.14 
 
 
296 aa  63.2  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1262  ISPg3, transposase  25.1 
 
 
300 aa  62.8  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0710  transposase  24.14 
 
 
296 aa  62.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.987905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0310  transposase IS4 family protein  25.41 
 
 
292 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0996  transposase  24.14 
 
 
296 aa  62.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.440255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2701  transposase IS4 family protein  25.41 
 
 
292 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1841  transposase  24.14 
 
 
296 aa  62.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.353065  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0070  transposase  24.14 
 
 
296 aa  62.4  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00361102  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1723  transposase  24.14 
 
 
296 aa  62.4  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0603251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>