124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2488 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2488  putative transposase  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2483  transposase, IS4  23.94 
 
 		 293 aa  68.2  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0359  IS4 family transposase  23.89 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.441685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0407  IS4 family transposase  23.89 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547418 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0414  IS4 family transposase  23.89 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0545  IS4 family transposase  23.89 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0933  IS4 family transposase  23.89 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.148656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0944  IS4 family transposase  23.89 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1427  IS4 family transposase  23.89 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.716221  normal  0.315451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1490  IS4 family transposase  23.89 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.495373 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1748  IS4 family transposase  23.89 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.7477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2086  IS4 family transposase  23.89 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0165  hypothetical protein  25.14 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0220  transposase, IS4  26.92 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0248  transposase, IS4  26.92 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0387  transposase, IS4  26.92 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00245948  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0967  transposase, IS4  26.92 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1660  transposase, IS4  26.92 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1666  transposase, IS4  26.92 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2323  transposase, IS4  26.92 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4410  hypothetical protein  30.17 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0177998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1992  transposase IS4 family protein  26.56 
 
 		 297 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0069  transposase, IS4 family protein  24.32 
 
 		 299 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1008  transposase, putative  27.65 
 
 		 292 aa  52.4  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0798  ISPg3, transposase  25.75 
 
 		 300 aa  50.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0194  ISPg3, transposase  25.75 
 
 		 300 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.818516 
 
 
-
 
NC_002950  PG0261  ISPg3, transposase  25.75 
 
 		 300 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1032  ISPg3, transposase  25.75 
 
 		 300 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104806 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0112  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  49.3  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1209  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  49.3  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2597  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  49.3  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2721  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  49.3  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2950  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000202826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3189  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000374616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2768  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0213708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2666  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000825775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3432  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0310  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3325  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0303037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0656  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3350  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1410  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.9  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2798  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2701  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3599  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0109745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1443  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0703  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0250  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3335  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2062  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000149012  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1672  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1807  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2012  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2055  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.862347  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1703  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.5  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0762  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.5  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3382  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0393001  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0702  transposase, IS4 family protein  23.63 
 
 		 289 aa  48.1  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_002950  PG1262  ISPg3, transposase  25.15 
 
 		 300 aa  48.1  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2469  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0038  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0286  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0317  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0444  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0744  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.506929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0862  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0917  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0959  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0972  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260253  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1051  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1218  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.148631  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1276  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.623612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1339  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1348  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1365  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1441  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.363136  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1459  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1522  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1601  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.174861  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1605  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1652  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158207  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1692  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.250991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2051  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687702  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2394  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2430  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2543  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2863  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2874  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0008  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.919788  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0041  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0097  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0158  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0192  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.56345  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0260  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268391  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0419  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0465  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0495  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0643  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0818501  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0689  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0778  transposase  22.28 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>