192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2086 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0359  IS4 family transposase  100 
 
 
293 aa  613  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.441685  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0407  IS4 family transposase  100 
 
 
293 aa  613  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547418 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0414  IS4 family transposase  100 
 
 
293 aa  613  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0545  IS4 family transposase  100 
 
 
293 aa  613  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0933  IS4 family transposase  100 
 
 
293 aa  613  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.148656  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0944  IS4 family transposase  100 
 
 
293 aa  613  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1427  IS4 family transposase  100 
 
 
293 aa  613  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.716221  normal  0.315451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1490  IS4 family transposase  100 
 
 
293 aa  613  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.495373 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1748  IS4 family transposase  100 
 
 
293 aa  613  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.7477  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2086  IS4 family transposase  100 
 
 
293 aa  613  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2483  transposase, IS4  94.2 
 
 
293 aa  587  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0220  transposase, IS4  31.82 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0248  transposase, IS4  31.82 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0387  transposase, IS4  31.82 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00245948  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0967  transposase, IS4  31.82 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1660  transposase, IS4  31.82 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1666  transposase, IS4  31.82 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2323  transposase, IS4  31.82 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0165  hypothetical protein  36.02 
 
 
291 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0476  transposase  29.44 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0801  transposase  29.44 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000583007  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2313  transposase  29.44 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.101441  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2360  transposase  29.44 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.398217  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2428  transposase  29.44 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1723  transposase  29 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0603251  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1601  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.174861  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1692  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.250991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2251  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1652  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158207  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1441  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.363136  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0862  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0809  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1276  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.623612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1051  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0972  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260253  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1218  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.148631  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1348  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1339  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1365  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0444  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0917  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0260  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268391  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0465  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2394  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0495  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2051  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687702  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2323  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2874  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3002  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0158  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0192  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.56345  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2430  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1993  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2469  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0419  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0778  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1777  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.167133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1605  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2543  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0008  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.919788  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0041  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2015  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0643  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0818501  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0689  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2863  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2070  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0097  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1459  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1522  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0959  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1410  transposase  27.48 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0744  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.506929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0038  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0201  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.939857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0286  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0317  transposase  26.73 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933695  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D34  transposase  29.44 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0159286  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0919  transposase  28.57 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00272522  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0958  transposase  29 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146324  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1346  transposase  29 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000526235  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2303  transposase  29 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000726032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0057  transposase  29 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.033451  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0350  transposase  29 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.676447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0376  transposase  29 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0527454  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0679  transposase  29 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00272522  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1227  transposase  29 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00543475  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2035  transposase  29 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0151047  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2203  transposase  29 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00928049  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2462  transposase  29 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1516  transposase  29 
 
 
296 aa  95.9  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000441669  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1738  transposase  29 
 
 
296 aa  95.9  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0265447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0070  transposase  29 
 
 
296 aa  95.9  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00361102  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0675  transposase  29 
 
 
296 aa  95.9  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10833  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0710  transposase  29 
 
 
296 aa  95.9  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.987905  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0728  transposase  29 
 
 
296 aa  95.9  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0943  transposase  29 
 
 
296 aa  95.9  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000548004  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2007  transposase  29 
 
 
296 aa  95.9  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2018  transposase  29 
 
 
296 aa  95.9  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316916  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2597  transposase  26.4 
 
 
293 aa  95.9  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0990  transposase  29 
 
 
296 aa  95.9  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>