213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2323 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0220  transposase, IS4  100 
 
 		 315 aa  649    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0248  transposase, IS4  100 
 
 		 315 aa  649    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0387  transposase, IS4  100 
 
 		 315 aa  649    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00245948  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0967  transposase, IS4  100 
 
 		 315 aa  649    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1660  transposase, IS4  100 
 
 		 315 aa  649    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1666  transposase, IS4  100 
 
 		 315 aa  649    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2323  transposase, IS4  100 
 
 		 315 aa  649    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2483  transposase, IS4  31.47 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0359  IS4 family transposase  31.47 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.441685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0407  IS4 family transposase  31.47 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547418 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0414  IS4 family transposase  31.47 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0545  IS4 family transposase  31.47 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0933  IS4 family transposase  31.47 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.148656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0944  IS4 family transposase  31.47 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1427  IS4 family transposase  31.47 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.716221  normal  0.315451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1490  IS4 family transposase  31.47 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.495373 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1748  IS4 family transposase  31.47 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.7477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2086  IS4 family transposase  31.47 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1387  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2012  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1672  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2666  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000825775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3382  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0393001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0250  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2768  transposase IS4 family protein  34.57 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0213708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1807  transposase IS4 family protein  34.57 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2950  transposase IS4 family protein  34.57 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000202826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3325  transposase IS4 family protein  34.57 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0303037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0703  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3432  transposase IS4 family protein  33.86 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2062  transposase IS4 family protein  33.86 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000149012  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3189  transposase IS4 family protein  34.57 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000374616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2055  transposase IS4 family protein  33.86 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.862347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1443  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3335  transposase IS4 family protein  33.86 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3350  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0656  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0310  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 		 292 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2701  transposase IS4 family protein  34.16 
 
 		 292 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2070  transposase IS4 family protein  33.07 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2727  transposase IS4 family protein  33.46 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1842  transposase IS4 family protein  33.46 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3267  transposase IS4 family protein  33.46 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0878  transposase IS4 family protein  33.46 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3599  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 		 292 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0109745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2798  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 		 292 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1925  transposase IS4 family protein  33.07 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3571  transposase IS4 family protein  29.9 
 
 		 273 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2283  transposase IS4 family protein  29.9 
 
 		 273 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1975  transposase IS4 family protein  29.55 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal  0.187697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2860  transposase IS4 family protein  29.55 
 
 		 273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3128  transposase IS4 family protein  29.55 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.205548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3563  transposase IS4 family protein  29.55 
 
 		 273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3162  transposase IS4 family protein  29.76 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1992  transposase IS4 family protein  24.09 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0423  transposase  28.89 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0483061  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1346  transposase  30.26 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000526235  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0350  transposase  29.52 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.676447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0057  transposase  28.89 
 
 		 296 aa  99.4  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.033451  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0376  transposase  29.52 
 
 		 296 aa  99.4  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0527454  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1227  transposase  29.52 
 
 		 296 aa  99.4  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00543475  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1943  transposase  29.52 
 
 		 296 aa  99  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000687064  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1989  transposase  28.89 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.588662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0958  transposase  29.15 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146324  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0996  transposase  28.52 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.440255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1723  transposase  29.15 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0603251  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1841  transposase  28.52 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.353065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4410  hypothetical protein  25.34 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0177998 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0675  transposase  28.52 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10833  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0679  transposase  29.15 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00272522  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0710  transposase  28.52 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.987905  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0943  transposase  28.52 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000548004  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1516  transposase  28.52 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000441669  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1738  transposase  28.52 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0265447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2035  transposase  29.15 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0151047  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2203  transposase  29.15 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00928049  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2462  transposase  29.15 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0476  transposase  29.15 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0801  transposase  29.15 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000583007  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2007  transposase  28.52 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2313  transposase  29.15 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.101441  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2360  transposase  29.15 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.398217  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2428  transposase  29.15 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0286  transposase  29.2 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0205191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0733  transposase  28.52 
 
 		 284 aa  96.7  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0117119  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1339  transposase  29.15 
 
 		 284 aa  96.7  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.179183  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2066  transposase  28.52 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C45  transposase  28.52 
 
 		 296 aa  96.3  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0924  transposase  28.52 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0448539  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D34  transposase  28.52 
 
 		 296 aa  95.9  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0159286  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D36  transposase  28.78 
 
 		 284 aa  95.5  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0652132  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0990  transposase  29.89 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1315  transposase  28.78 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1380  transposase  28.78 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.389447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1437  transposase  28.78 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000448786  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1520  transposase  28.15 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00361102  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2303  transposase  29.15 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000726032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0728  transposase  28.78 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0919  transposase  29.89 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00272522  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2211  transposase  28.78 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0151047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>