20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0210 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0210  fibronectin, type III  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000708597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0157  fibronectin type III domain-containing protein  71.55 
 
 		 257 aa  329  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0232  fibronectin, type III domain-containing protein  48.52 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3749  fibronectin, type III domain protein  44.18 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3642  fibronectin, type III domain protein  43.5 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3167  fibronectin type III domain-containing protein  35.37 
 
 		 254 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2419  hypothetical protein  32.47 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000793274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3144  fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0542541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0059  fibronectin, type III domain-containing protein  25.79 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  34.27 
 
 		 1199 aa  58.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0196  fibronectin, type III  26 
 
 		 354 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  33.09 
 
 		 1160 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  26.32 
 
 		 9585 aa  45.4  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  30.74 
 
 		 3802 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  28.57 
 
 		 903 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  26.63 
 
 		 4433 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0017  fibronectin type III domain protein  20.2 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.857049  normal  0.0757173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  30.7 
 
 		 1695 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  26.96 
 
 		 741 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  28.35 
 
 		 1550 aa  42  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>