More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1413 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1413  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
314 aa  622  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4376  UDP-glucose pyrophosphorylase  81.16 
 
 
303 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462383  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4668  UDP-glucose pyrophosphorylase  81.16 
 
 
303 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0171548  normal  0.67599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1897  nucleotidyl transferase  81.16 
 
 
306 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650188  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3268  Nucleotidyl transferase  80 
 
 
298 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4833  nucleotidyl transferase  80.48 
 
 
307 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4290  UDP-glucose pyrophosphorylase  80.7 
 
 
290 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11011  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase galU  77.13 
 
 
306 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.418758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0628  Nucleotidyl transferase  69.44 
 
 
293 aa  363  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32670  UDP-glucose pyrophosphorylase  66.44 
 
 
300 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.350169  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0745  putative UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  50.35 
 
 
318 aa  248  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143994  normal  0.727041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0692  nucleotidyl transferase  48.96 
 
 
318 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.777421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6321  Nucleotidyl transferase  46.21 
 
 
298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1219  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  47.97 
 
 
296 aa  235  6e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3689  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  46.6 
 
 
310 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0800365  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4040  UDP-glucose pyrophosphorylase  43.81 
 
 
348 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08870  UDP-glucose pyrophosphorylase  45.95 
 
 
304 aa  231  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23880  UDP-glucose pyrophosphorylase  45.36 
 
 
325 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0884  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.82 
 
 
304 aa  222  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1717  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  45.45 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4087  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.14 
 
 
312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0166  UDP-glucose pyrophosphorylase  46.71 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0911  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.62 
 
 
301 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3101  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  41.1 
 
 
288 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0218  UDP-glucose pyrophosphorylase  43.3 
 
 
297 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1369  UDP-glucose pyrophosphorylase  43.01 
 
 
314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2864  UDP-glucose pyrophosphorylase  48.12 
 
 
301 aa  219  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2091  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  44.33 
 
 
286 aa  219  6e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1549  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  46.64 
 
 
297 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.416481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8649  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.37 
 
 
299 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3577  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.6 
 
 
298 aa  218  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.125314  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1737  UDP-glucose pyrophosphorylase  45.7 
 
 
293 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793832  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0507  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.15 
 
 
291 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0029114  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0121  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.3 
 
 
290 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0207339 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1970  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.06 
 
 
290 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2537  UDP-glucose pyrophosphorylase  41.95 
 
 
292 aa  215  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.619652 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0481  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  43.45 
 
 
287 aa  215  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0151475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4112  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  42.66 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0241424  hitchhiker  0.000234521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2571  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  46.49 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185896 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2800  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.44 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324628 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1592  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.79 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414437  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2117  UDP-glucose pyrophosphorylase  44.37 
 
 
292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0236  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  41.81 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0791459  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1022  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.6 
 
 
292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1334  UDP-glucose pyrophosphorylase  44.83 
 
 
293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0015  UDP-glucose pyrophosphorylase  42.86 
 
 
297 aa  212  7.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000637346  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0469  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  41.3 
 
 
314 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0487  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  41.3 
 
 
314 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0251732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1359  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.33 
 
 
294 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1320  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.33 
 
 
294 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0112  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.93 
 
 
306 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3723  UDP-glucose pyrophosphorylase  44.29 
 
 
299 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.61357  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1095  UDP-glucose pyrophosphorylase  45.02 
 
 
293 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0958  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.98 
 
 
294 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1418  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.98 
 
 
294 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1440  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.98 
 
 
294 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7385  UDP-glucose pyrophosphorylase  44.52 
 
 
294 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1875  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.98 
 
 
294 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35135  normal  0.0372426 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0423  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.33 
 
 
293 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0926  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.33 
 
 
293 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1845  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.33 
 
 
293 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2634  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.33 
 
 
294 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0740  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.33 
 
 
293 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5550  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.79 
 
 
298 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.719818 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1459  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.33 
 
 
293 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1668  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.33 
 
 
293 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1690  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.33 
 
 
293 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4584  UDP-glucose pyrophosphorylase  44.98 
 
 
294 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0450  UDP-glucose pyrophosphorylase  40.48 
 
 
312 aa  209  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1172  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  40.82 
 
 
293 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.151535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4550  UDP-glucose pyrophosphorylase  43.6 
 
 
299 aa  209  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  0.111674 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0465  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  41.92 
 
 
306 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.021215  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3209  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.56 
 
 
294 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3261  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.56 
 
 
294 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2751  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  44.48 
 
 
297 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.210173  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0483  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  41.58 
 
 
306 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.350857  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1435  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.25 
 
 
294 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.36592  normal  0.483741 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3248  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.56 
 
 
294 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2237  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  40.28 
 
 
302 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0859  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  40.68 
 
 
289 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00129209  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2297  nucleotidyl transferase  42.71 
 
 
296 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0260595  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3188  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.15 
 
 
301 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.492305  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1159  UDP-glucose pyrophosphorylase  40 
 
 
291 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000567806  decreased coverage  0.00280278 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2183  UDP-glucose pyrophosphorylase  41.32 
 
 
289 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2718  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  41.72 
 
 
288 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0487  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  46.26 
 
 
296 aa  206  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0862  UDP-glucose pyrophosphorylase  44.98 
 
 
298 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1363  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.56 
 
 
293 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2631  UDP-glucose pyrophosphorylase  44.33 
 
 
299 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0067419  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3175  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  42.41 
 
 
301 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0385724 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2237  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase protein  44.98 
 
 
289 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6276  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.06 
 
 
293 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2189  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  41.98 
 
 
301 aa  206  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736355  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2049  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.98 
 
 
290 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244059  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6189  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.18 
 
 
294 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.642524  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0373  UDP-glucose pyrophosphorylase  43.4 
 
 
309 aa  205  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1498  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  42.07 
 
 
288 aa  205  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000563267  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1652  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.88 
 
 
292 aa  205  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.601586  normal  0.125455 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1627  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  40.91 
 
 
287 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2953  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.9 
 
 
296 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>