41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3164 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3164  VanZ family protein  100 
 
 
196 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2684  vanZ protein, putative  29.35 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0413993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2680  teicoplanin resistance protein VanZ  31.35 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2484  VanZ family protein  35.33 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000301645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2631  teicoplanin resistance protein VanZ  30.61 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.47817  decreased coverage  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2396  teicoplanin resistance protein  32.53 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0510  hypothetical protein  34.31 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.501787 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2187  VanZ family protein  30.07 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000988027  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1340  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.68 
 
 
669 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.774889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3988  VanZ family protein  32.98 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.425328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1601  VanZ family protein  27.92 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0259  glycopeptide antibiotics resistance protein  30.56 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2015  VanZ family protein  26.97 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0179065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0490  VanZ family protein  26.86 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3207  protein VanZ  30.5 
 
 
177 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1911  hypothetical protein  29.38 
 
 
354 aa  49.3  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5083  hypothetical protein  35.64 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0595  VanZ family protein  37.5 
 
 
384 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0612  VanZ family protein  41.25 
 
 
361 aa  48.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3806  VanZ family protein  36.84 
 
 
172 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1841  VanZ family protein  30.83 
 
 
173 aa  48.1  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4846  hypothetical protein  31.37 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5212  hypothetical protein  31.37 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4625  hypothetical protein  39.51 
 
 
383 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000286703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0748  hypothetical protein  35 
 
 
383 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0711  hypothetical protein  35.87 
 
 
383 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0736  hypothetical protein  35 
 
 
383 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.02924e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0808  hypothetical protein  35 
 
 
383 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0592  hypothetical protein  35 
 
 
383 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0591  hypothetical protein  35 
 
 
383 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.527115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5115  hypothetical protein  33.61 
 
 
248 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0647  hypothetical protein  35 
 
 
383 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.716379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0681  hypothetical protein  35 
 
 
383 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0210  VanZ family protein  38.1 
 
 
387 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3474  VanZ family protein  34.18 
 
 
148 aa  45.1  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000194917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3291  VanZ family protein  28.7 
 
 
116 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00099005  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27280  glycopeptide antibiotics resistance protein  23.66 
 
 
231 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0585344  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1422  VanZ family protein  22.67 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0459  VanZF domain-containing protein  34.65 
 
 
171 aa  42  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3303  VanZ family protein  25.17 
 
 
188 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.68959  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0470  hypothetical protein  25.13 
 
 
230 aa  41.2  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>