41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2187 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2187  VanZ family protein  100 
 
 
194 aa  373  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000988027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1601  VanZ family protein  34.81 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2484  VanZ family protein  31.22 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000301645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2680  teicoplanin resistance protein VanZ  34.81 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2396  teicoplanin resistance protein  34.19 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2631  teicoplanin resistance protein VanZ  34.18 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.47817  decreased coverage  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2684  vanZ protein, putative  31.82 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0413993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2015  VanZ family protein  31.68 
 
 
185 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0179065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0490  VanZ family protein  32.74 
 
 
242 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0870  VanZ family protein  29.38 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3806  VanZ family protein  40.91 
 
 
172 aa  58.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4297  hypothetical protein  35.4 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1049  vanZ protein, putative  29.21 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.621429  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1911  hypothetical protein  28.14 
 
 
354 aa  55.1  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0886  teicoplanin resistance protein vanZ  37.76 
 
 
212 aa  54.7  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0750721  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0215  VanZ family protein  26.09 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0867  teicoplanin resistance protein  34.02 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0904  hypothetical protein  37.63 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0962  hypothetical protein  37.63 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1046  hypothetical protein  37.63 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0067199999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3164  VanZ family protein  25.97 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3988  VanZ family protein  26.26 
 
 
198 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.425328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1340  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.8 
 
 
669 aa  47.8  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.774889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0612  VanZ family protein  30.22 
 
 
361 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542073  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1302  VanZ family protein  28.57 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2373  VanZ family protein  36.49 
 
 
156 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.521595  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0808  hypothetical protein  32.77 
 
 
383 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0595  VanZ family protein  32.77 
 
 
384 aa  44.7  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0711  hypothetical protein  34.21 
 
 
383 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0748  hypothetical protein  34.21 
 
 
383 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38730  glycopeptide antibiotics resistance protein  33.33 
 
 
237 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4625  hypothetical protein  34.21 
 
 
383 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000286703 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3474  VanZ family protein  28.41 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000194917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0592  hypothetical protein  33.64 
 
 
383 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0736  hypothetical protein  33.64 
 
 
383 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.02924e-25 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08070  glycopeptide antibiotics resistance protein  31.94 
 
 
409 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000781002 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0591  hypothetical protein  33.64 
 
 
383 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.527115  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2680  VanZ family protein  42.86 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0681  hypothetical protein  33.64 
 
 
383 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0647  hypothetical protein  33.64 
 
 
383 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.716379  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0489  glycopeptide antibiotics resistance protein  25.6 
 
 
344 aa  42  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>