30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0259 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0259  glycopeptide antibiotics resistance protein  100 
 
 
216 aa  438  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2484  VanZ family protein  26.63 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000301645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2684  vanZ protein, putative  24.74 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0413993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2396  teicoplanin resistance protein  26.84 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2680  teicoplanin resistance protein VanZ  26.52 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4297  hypothetical protein  37.5 
 
 
216 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1046  hypothetical protein  36.36 
 
 
212 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0067199999999997e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1049  vanZ protein, putative  40.22 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.621429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2631  teicoplanin resistance protein VanZ  26.52 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.47817  decreased coverage  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0904  hypothetical protein  34.55 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0962  hypothetical protein  34.55 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0870  VanZ family protein  38.05 
 
 
208 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0886  teicoplanin resistance protein vanZ  34.55 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0750721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0867  teicoplanin resistance protein  33.33 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3474  VanZ family protein  34.74 
 
 
148 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000194917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3806  VanZ family protein  30.49 
 
 
172 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0210  VanZ family protein  35.34 
 
 
387 aa  45.1  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0681  hypothetical protein  30 
 
 
383 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0592  hypothetical protein  30 
 
 
383 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0591  hypothetical protein  30 
 
 
383 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.527115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0736  hypothetical protein  30 
 
 
383 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.02924e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0647  hypothetical protein  30 
 
 
383 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.716379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0490  VanZ family protein  29.81 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3291  VanZ family protein  29.41 
 
 
116 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00099005  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0612  VanZ family protein  33.03 
 
 
361 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542073  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1911  hypothetical protein  36.84 
 
 
354 aa  43.5  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5115  hypothetical protein  27.72 
 
 
248 aa  42  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0711  hypothetical protein  29.29 
 
 
383 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0808  hypothetical protein  28 
 
 
383 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0748  hypothetical protein  29.29 
 
 
383 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>