27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3291 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3291  VanZ family protein  100 
 
 
116 aa  233  8e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00099005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5083  hypothetical protein  40.43 
 
 
242 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08310  VanZ family protein  40.82 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5115  hypothetical protein  40 
 
 
248 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4846  hypothetical protein  37 
 
 
248 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5212  hypothetical protein  35.35 
 
 
178 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2396  teicoplanin resistance protein  30.51 
 
 
210 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2695  VanZ family protein  39.02 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000114931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2684  vanZ protein, putative  28.8 
 
 
210 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0413993  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3474  VanZ family protein  28.57 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000194917  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2575  VanZ like family protein  33.71 
 
 
213 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0510  hypothetical protein  42.37 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.501787 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2896  vanZ family protein  33.71 
 
 
213 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2680  teicoplanin resistance protein VanZ  30.4 
 
 
210 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0867  teicoplanin resistance protein  39.74 
 
 
211 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4297  hypothetical protein  38.03 
 
 
216 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2484  VanZ family protein  29.82 
 
 
210 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000301645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0870  VanZ family protein  36.36 
 
 
208 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2631  teicoplanin resistance protein VanZ  28.8 
 
 
210 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.47817  decreased coverage  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0962  hypothetical protein  37.88 
 
 
206 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0904  hypothetical protein  37.88 
 
 
212 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1049  vanZ protein, putative  35.21 
 
 
216 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.621429  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0259  glycopeptide antibiotics resistance protein  29.41 
 
 
216 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0886  teicoplanin resistance protein vanZ  35.62 
 
 
212 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0750721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1046  hypothetical protein  36.36 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0067199999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2373  VanZ family protein  33.33 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.521595  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0215  VanZ family protein  27.36 
 
 
203 aa  40.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>