33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2015 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2015  VanZ family protein  100 
 
 
185 aa  371  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0179065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2484  VanZ family protein  29.19 
 
 
210 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000301645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2631  teicoplanin resistance protein VanZ  30.29 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.47817  decreased coverage  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2396  teicoplanin resistance protein  29.61 
 
 
210 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2684  vanZ protein, putative  27.37 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0413993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2680  teicoplanin resistance protein VanZ  29.07 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2187  VanZ family protein  31.87 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000988027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0886  teicoplanin resistance protein vanZ  29.52 
 
 
212 aa  61.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0750721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0962  hypothetical protein  30.12 
 
 
206 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0904  hypothetical protein  30.12 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1046  hypothetical protein  28.92 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0067199999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2695  VanZ family protein  27.21 
 
 
137 aa  57.8  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000114931  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0867  teicoplanin resistance protein  29.09 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2373  VanZ family protein  32.87 
 
 
156 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.521595  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0490  VanZ family protein  35.66 
 
 
242 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0870  VanZ family protein  27.98 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1340  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.06 
 
 
669 aa  54.7  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.774889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4297  hypothetical protein  27.65 
 
 
216 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1049  vanZ protein, putative  29.53 
 
 
216 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.621429  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2680  VanZ family protein  29.38 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3806  VanZ family protein  36.17 
 
 
172 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0215  VanZ family protein  26.54 
 
 
203 aa  51.2  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1911  hypothetical protein  31.48 
 
 
354 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3474  VanZ family protein  35.11 
 
 
148 aa  48.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000194917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3207  protein VanZ  29.71 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2865  hypothetical protein  40.3 
 
 
255 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0612  VanZ family protein  40.28 
 
 
361 aa  44.7  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542073  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1257  glycopeptide antibiotics resistance protein  29.05 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000512133  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3988  VanZ family protein  24.4 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.425328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4846  hypothetical protein  37 
 
 
248 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5212  hypothetical protein  37 
 
 
178 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0711  hypothetical protein  31.46 
 
 
383 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3164  VanZ family protein  28.57 
 
 
196 aa  40.8  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>