More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1278 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1278  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
335 aa  681    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0395  rod shape-determining protein MreB  69.07 
 
 
335 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  45.99 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  45.06 
 
 
342 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  45.06 
 
 
342 aa  305  6e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  44.65 
 
 
346 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  45.09 
 
 
345 aa  298  6e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  45.77 
 
 
343 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  44.34 
 
 
346 aa  297  2e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  44.95 
 
 
346 aa  296  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2125  rod shape-determining protein MreB  43.77 
 
 
345 aa  297  2e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.55936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  43.2 
 
 
346 aa  296  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  44.34 
 
 
346 aa  297  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  44.79 
 
 
346 aa  296  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  45.82 
 
 
340 aa  295  5e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  45.06 
 
 
343 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  44.31 
 
 
347 aa  294  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  44.86 
 
 
339 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  43.33 
 
 
333 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  44.58 
 
 
340 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  44.44 
 
 
344 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0317  rod shape-determining protein MreB  43.56 
 
 
345 aa  294  2e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.594365  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  44.65 
 
 
346 aa  293  4e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  43.93 
 
 
339 aa  291  8e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  44.65 
 
 
346 aa  291  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  43.93 
 
 
339 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  43.93 
 
 
339 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  43.93 
 
 
339 aa  291  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  43.93 
 
 
339 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  43.25 
 
 
343 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  43.93 
 
 
339 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  43.93 
 
 
339 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  43.93 
 
 
338 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  44.14 
 
 
340 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  43.93 
 
 
339 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0868  rod shape-determining protein MreB  42.94 
 
 
345 aa  291  1e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  43.93 
 
 
339 aa  290  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  43.93 
 
 
339 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  43.96 
 
 
339 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  43.65 
 
 
343 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  43.83 
 
 
344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  42.42 
 
 
333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  43.52 
 
 
343 aa  289  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  43.89 
 
 
368 aa  288  6e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  43.65 
 
 
343 aa  288  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  44.24 
 
 
344 aa  288  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  43.57 
 
 
349 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  43.83 
 
 
354 aa  287  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  47.13 
 
 
346 aa  287  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  43.89 
 
 
343 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  42.72 
 
 
343 aa  287  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  43.3 
 
 
343 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  43.34 
 
 
342 aa  286  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  42.94 
 
 
343 aa  285  9e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  42.94 
 
 
344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  44.82 
 
 
344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  46.25 
 
 
358 aa  282  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  41.05 
 
 
343 aa  282  6.000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  41.88 
 
 
345 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3798  rod shape-determining protein Mbl  42.22 
 
 
333 aa  281  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000087539  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  43.21 
 
 
340 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  43.52 
 
 
347 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  42.94 
 
 
346 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1352  rod shape-determining protein MreB  42.28 
 
 
343 aa  281  1e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.261173  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  43.21 
 
 
344 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  45.94 
 
 
358 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1149  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  43.69 
 
 
344 aa  280  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000405935  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1465  rod shape-determining protein MreB  42.33 
 
 
345 aa  279  4e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  41.59 
 
 
342 aa  279  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4962  rod shape-determining protein Mbl  41.92 
 
 
333 aa  279  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.96321e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4974  rod shape-determining protein Mbl  41.92 
 
 
333 aa  279  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000021016  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  42.59 
 
 
336 aa  279  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  42.86 
 
 
342 aa  279  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5077  rod shape-determining protein Mbl  41.92 
 
 
333 aa  278  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000326742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5404  rod shape-determining protein Mbl  41.92 
 
 
333 aa  278  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000385561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5455  rod shape-determining protein Mbl  41.92 
 
 
333 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  43.52 
 
 
343 aa  278  7e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  41.72 
 
 
345 aa  278  8e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5128  rod shape-determining protein Mbl  41.62 
 
 
333 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000379199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5520  rod shape-determining protein Mbl  41.62 
 
 
333 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5369  rod shape-determining protein Mbl  41.62 
 
 
333 aa  278  9e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_002620  TC0082  rod shape-determining protein MreB  44.44 
 
 
366 aa  278  1e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  44 
 
 
342 aa  278  1e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  45.17 
 
 
359 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  42.41 
 
 
350 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5400  rod shape-determining protein Mbl  41.62 
 
 
333 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000418455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5550  rod shape-determining protein Mbl  41.62 
 
 
333 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581144  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  42.81 
 
 
345 aa  277  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1215  rod shape-determining protein MreB  43.88 
 
 
333 aa  277  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.020325  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  41.52 
 
 
345 aa  277  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0983  rod shape-determining protein MreB  44.72 
 
 
336 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.408355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  42.46 
 
 
353 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  41.9 
 
 
346 aa  276  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  43.38 
 
 
338 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0573  rod shape-determining protein MreB  43.29 
 
 
335 aa  276  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.788232  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  43.07 
 
 
346 aa  276  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  42.99 
 
 
339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  41.59 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2128  rod shape-determining protein MreB  43.43 
 
 
348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  41.28 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>