More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0395 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0395  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
335 aa  679    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1278  rod shape-determining protein MreB  69.07 
 
 
335 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 
346 aa  341  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  49.85 
 
 
344 aa  332  4e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  49.54 
 
 
339 aa  332  8e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 
343 aa  332  8e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  47.48 
 
 
338 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  49.09 
 
 
340 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  49.39 
 
 
342 aa  329  4e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  49.39 
 
 
342 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  47.18 
 
 
339 aa  328  6e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  47.18 
 
 
339 aa  328  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  47.18 
 
 
339 aa  328  6e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  47.18 
 
 
339 aa  328  6e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  47.18 
 
 
339 aa  328  6e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  47.18 
 
 
339 aa  328  6e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  47.18 
 
 
339 aa  328  6e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  48.33 
 
 
343 aa  328  8e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  47.18 
 
 
339 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  47.18 
 
 
339 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  48.31 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  49.7 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.18 
 
 
344 aa  327  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  46.88 
 
 
339 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  46.88 
 
 
343 aa  326  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  48.94 
 
 
340 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  50.77 
 
 
343 aa  325  5e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  49.7 
 
 
340 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  47.08 
 
 
343 aa  324  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  46.29 
 
 
343 aa  325  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  48.65 
 
 
346 aa  323  2e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  46.67 
 
 
344 aa  323  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  49.55 
 
 
340 aa  322  5e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  48.79 
 
 
343 aa  321  8e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  48.35 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  48.35 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  48.6 
 
 
339 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  48.48 
 
 
333 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  48.93 
 
 
343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  45.86 
 
 
368 aa  318  6e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  48.78 
 
 
344 aa  317  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  49.26 
 
 
346 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  47.89 
 
 
345 aa  317  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.27 
 
 
350 aa  316  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2125  rod shape-determining protein MreB  47.72 
 
 
345 aa  317  3e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.55936  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0573  rod shape-determining protein MreB  47.11 
 
 
335 aa  316  3e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.788232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  48.18 
 
 
333 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  46.71 
 
 
336 aa  316  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  49.84 
 
 
344 aa  315  6e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 
343 aa  315  9.999999999999999e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  48.62 
 
 
358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  48.04 
 
 
345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0317  rod shape-determining protein MreB  46.5 
 
 
345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.594365  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.6 
 
 
344 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  46.71 
 
 
346 aa  312  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  45.02 
 
 
345 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  47.43 
 
 
358 aa  312  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  44.85 
 
 
344 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_002620  TC0082  rod shape-determining protein MreB  47.58 
 
 
366 aa  311  9e-84  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  47.34 
 
 
342 aa  311  1e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0868  rod shape-determining protein MreB  46.81 
 
 
345 aa  311  1e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1149  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.01 
 
 
344 aa  311  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000405935  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  46.85 
 
 
346 aa  310  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  46.2 
 
 
342 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  44.97 
 
 
345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1215  rod shape-determining protein MreB  48.33 
 
 
333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.020325  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1465  rod shape-determining protein MreB  46.67 
 
 
345 aa  309  5e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28948  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  47.58 
 
 
344 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  46.46 
 
 
353 aa  309  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  44.74 
 
 
343 aa  308  6.999999999999999e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  45.79 
 
 
343 aa  308  6.999999999999999e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  47.58 
 
 
344 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  47.58 
 
 
344 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  47.58 
 
 
344 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  47.58 
 
 
344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  47.58 
 
 
344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1352  rod shape-determining protein MreB  48.02 
 
 
343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.261173  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  46.11 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  46.87 
 
 
347 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  46.27 
 
 
345 aa  305  6e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  47.58 
 
 
344 aa  305  6e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  45.76 
 
 
338 aa  305  7e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  46.83 
 
 
342 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  46.29 
 
 
347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  46.32 
 
 
359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  45.83 
 
 
347 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  46.67 
 
 
343 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  46.11 
 
 
346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0512  rod shape-determining protein MreB  45.59 
 
 
333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0061  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  46.43 
 
 
337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  43.15 
 
 
342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0471  rod shape-determining protein MreB  45.57 
 
 
330 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000843079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  46.79 
 
 
339 aa  302  5.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  45.81 
 
 
346 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  46.29 
 
 
347 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  48.64 
 
 
345 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  48.64 
 
 
345 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  48.64 
 
 
345 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  48.34 
 
 
345 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2128  rod shape-determining protein MreB  47.42 
 
 
348 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>