More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_R0087 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_R0087  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5707  tRNA-Val  97.78 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-1  tRNA-Val  97.78 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.987752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-2  tRNA-Val  97.78 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-4  tRNA-Val  97.78 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.834758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0117  tRNA-Val  97.78 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5751  tRNA-Val  97.78 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-5  tRNA-Val  97.78 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4021  tRNA-Val  97.78 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350384 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1426  tRNA-Val  97.78 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.842618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0118  tRNA-Val  97.78 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1350  tRNA-Val  97.78 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2795400000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0113  tRNA-Val  97.78 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0026  tRNA-Val  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0010  tRNA-Val  92.73 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.239466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0028  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.148209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4668  tRNA-Val  88.06 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314949  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1570  tRNA-Val  86.57 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.736418  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0021  tRNA-Val  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.824854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0056  tRNA-Gly  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0041  tRNA-Gly  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126738  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00028  tRNA-Val  86.57 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.813226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0047  tRNA-Val  86.57 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0063  tRNA-Val  86.57 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000215806  hitchhiker  0.00000333382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0061  tRNA-Val  86.57 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000225678  hitchhiker  0.00000327406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2379  tRNA-Val  86.57 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000292558  hitchhiker  0.00911124 
 
 
-
 
NC_003295  RS05795  tRNA-OTHER  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4229  tRNA-Val  86.57 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000067821  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0054  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0053  tRNA-Val  86.57 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452595  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0025  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0010  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116783  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0021  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0062  tRNA-Val  86.57 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000022739  hitchhiker  0.00000336445 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0026  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.211344  normal  0.0167997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0017  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00286264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0049  tRNA-Val  89.09 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00100813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0076  tRNA-Val  86.57 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00448767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4230  tRNA-Val  86.57 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000689927  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0010  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00245461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0033  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.688616  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0033  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_R0076  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.369233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0043  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0032  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.100652  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0050  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0857362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0022  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.766553  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15490  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0015  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000941457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0080  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217837  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2580  tRNA-Val  86.57 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0938444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0029  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0041  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0041  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0045  tRNA-Val  86.57 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0045  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00877282  normal  0.995576 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1531  tRNA-Val  86.57 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000929457  hitchhiker  0.00112826 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0020  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.649475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0054  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322484  hitchhiker  0.000000167745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2149  tRNA-Val  86.57 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000169486  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0029  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0016  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0039  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0358134  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0042  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.921175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0054  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5036  tRNA-Val  86.57 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151572  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0045  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1202  tRNA-Val  86.57 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0491839  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0026  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.478102  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0047  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.877588  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15520  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0029  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804432  normal  0.0419406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0042  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0075  tRNA-Val  86.57 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00433017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0121  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000223353  normal  0.991143 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0069  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229651  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0118  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00020053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0060  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000229541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0122  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000703597  normal  0.991143 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0093  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0093  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000828011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0092  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000905029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0123  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000761032  normal  0.999094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0094  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000297438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0119  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000206834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0098  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0099  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868138  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0100  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000389381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0101  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000312411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0102  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000271468  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0103  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000279802  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0083  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000495241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0120  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000221581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0063  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000284788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0117  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000194506  normal  0.999094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0034  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000134518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0035  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0036  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000113346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0037  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000120415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>