52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_R0113 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A1426  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.842618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5707  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-4  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.834758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5751  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1350  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2795400000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0118  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0113  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0117  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  143  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.987752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-2  tRNA-Val  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-5  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4021  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350384 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0087  tRNA-Val  97.78 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10770  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.029864  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10740  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0089339  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0048  tRNA-Gly  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.395068  normal  0.100997 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0046  tRNA-Gly  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.100607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0039  tRNA-Gly  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0010  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.239466  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0037  tRNA-Gly  86.79 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0035  tRNA-Gly  86.79 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0032  tRNA-Gly  86.79 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000809268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0034  tRNA-Gly  86.79 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371143  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt44  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.305367 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0057  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000972569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0038  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.351853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0039  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169853  normal  0.361721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0056  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00797069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3200t  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0010  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0183648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3202t  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3205t  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0011  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0036  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0035  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04003  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000136534  normal  0.315468 
 
 
-
 
NC_003295  RS04004  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000202158  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0037  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670203 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0025  tRNA-Ala  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0039  tRNA-Ala  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000281938  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0025  tRNA-Ala  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000151787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0040  tRNA-Ala  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000050813  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3198t  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0037  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.694382  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0039  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0007  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38046  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0008  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.521069  normal  0.137143 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3173t  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00082195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3175t  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000787171  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3196t  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1570  tRNA-Val  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.736418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>