31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3427 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3427  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  218  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0173  hypothetical protein  84.55 
 
 		 110 aa  167  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0823  hypothetical protein  69.09 
 
 		 110 aa  155  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0857  hypothetical protein  49.09 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0420  hypothetical protein  38.82 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0359883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3578  hypothetical protein  31.48 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0446  hypothetical protein  31.33 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.156414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1798  hypothetical protein  30.56 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1764  hypothetical protein  30.56 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4986  hypothetical protein  33.03 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1583  hypothetical protein  30.56 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000285876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1574  hypothetical protein  30.56 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1825  hypothetical protein  30.56 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1748  hypothetical protein  31.63 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1879  hypothetical protein  31.63 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1622  hypothetical protein  31.63 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1404  hypothetical protein  32.65 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.230162  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1782  hypothetical protein  33.75 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3375  hypothetical protein  30.23 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000793072  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1797  hypothetical protein  32.22 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.0320282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1622  hypothetical protein  31.82 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.960168  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1918  hypothetical protein  34.72 
 
 		 116 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.393175  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2100  hypothetical protein  25.61 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0567  hypothetical protein  32.05 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06048  hypothetical protein  28.21 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0041  hypothetical protein  30 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0044  hypothetical protein  30 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.185478  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0041  hypothetical protein  30 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0027  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345558 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001367  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.17 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4389  hypothetical protein  28.21 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>