29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0173 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0173  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  216  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3427  hypothetical protein  84.55 
 
 
110 aa  167  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0823  hypothetical protein  67.27 
 
 
110 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0857  hypothetical protein  49.09 
 
 
110 aa  114  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0420  hypothetical protein  38.82 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0359883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1797  hypothetical protein  34 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.0320282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0446  hypothetical protein  30.67 
 
 
116 aa  53.9  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.156414  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4986  hypothetical protein  37.5 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3375  hypothetical protein  30.34 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000793072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3578  hypothetical protein  30.56 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1782  hypothetical protein  33.75 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34032  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2100  hypothetical protein  28.72 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1764  hypothetical protein  29.63 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1798  hypothetical protein  29.63 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1825  hypothetical protein  29.63 
 
 
109 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1574  hypothetical protein  29.63 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1583  hypothetical protein  29.63 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000285876  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1918  hypothetical protein  32.29 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.393175  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1748  hypothetical protein  30.61 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1879  hypothetical protein  30.61 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1404  hypothetical protein  30.61 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.230162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1622  hypothetical protein  30.61 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1622  hypothetical protein  30.68 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.960168  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0567  hypothetical protein  29.41 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0027  hypothetical protein  30.14 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000345558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0044  hypothetical protein  30.14 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.185478  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0041  hypothetical protein  30.14 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944894  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0041  hypothetical protein  30.14 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107045 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06048  hypothetical protein  26.76 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>