33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0823 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0823  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3427  hypothetical protein  69.09 
 
 
110 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0173  hypothetical protein  67.27 
 
 
110 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0857  hypothetical protein  46.36 
 
 
110 aa  114  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3578  hypothetical protein  34.09 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3375  hypothetical protein  31.4 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000793072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1825  hypothetical protein  32.95 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1622  hypothetical protein  32.95 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1583  hypothetical protein  32.95 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000285876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1574  hypothetical protein  32.95 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1798  hypothetical protein  32.95 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1748  hypothetical protein  32.95 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1764  hypothetical protein  32.95 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1879  hypothetical protein  32.95 
 
 
109 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1622  hypothetical protein  31.63 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.960168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1404  hypothetical protein  33.71 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.230162  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2100  hypothetical protein  23.3 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0567  hypothetical protein  30.99 
 
 
116 aa  50.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0420  hypothetical protein  29.41 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0359883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1797  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.0320282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0044  hypothetical protein  32.39 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.185478  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0041  hypothetical protein  32.39 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944894  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0027  hypothetical protein  32.39 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000345558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0041  hypothetical protein  32.39 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107045 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1782  hypothetical protein  30 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34032  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0446  hypothetical protein  25.35 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.156414  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06048  hypothetical protein  26.76 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1918  hypothetical protein  30.56 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.393175  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4986  hypothetical protein  25.88 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0892  hypothetical protein  29.63 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4389  hypothetical protein  27.4 
 
 
116 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.487019 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2175  hypothetical protein  34 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001367  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.4 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>