33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2100 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2100  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  216  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1782  hypothetical protein  40.52 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0446  hypothetical protein  37.07 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.156414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1797  hypothetical protein  35.34 
 
 		 116 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.0320282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1918  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  88.6  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.393175  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4986  hypothetical protein  35.09 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001367  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  34.55 
 
 		 116 aa  76.6  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0567  hypothetical protein  34.55 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0027  hypothetical protein  32.76 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0041  hypothetical protein  32.76 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0044  hypothetical protein  32.76 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.185478  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0041  hypothetical protein  32.76 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0892  hypothetical protein  49.23 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06048  hypothetical protein  34.91 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0420  hypothetical protein  33.64 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0359883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2175  hypothetical protein  41.38 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4389  hypothetical protein  32.76 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487019 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0643  hypothetical protein  31.9 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1825  hypothetical protein  31 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1764  hypothetical protein  30 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1622  hypothetical protein  31 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1879  hypothetical protein  31 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1798  hypothetical protein  30 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3578  hypothetical protein  30 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1574  hypothetical protein  29 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1583  hypothetical protein  30 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000285876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1622  hypothetical protein  30 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.960168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1748  hypothetical protein  30.53 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3375  hypothetical protein  34.09 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000793072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1404  hypothetical protein  26.6 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.230162  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1833  hypothetical protein  36.36 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.128002  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2024  hypothetical protein  36.36 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0823  hypothetical protein  23.3 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>