31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3375 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3375  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  216  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000793072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1764  hypothetical protein  54.72 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1404  hypothetical protein  53.77 
 
 
109 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.230162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1879  hypothetical protein  54.21 
 
 
109 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1622  hypothetical protein  53.77 
 
 
109 aa  107  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.960168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1798  hypothetical protein  53.77 
 
 
109 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1825  hypothetical protein  53.77 
 
 
109 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1583  hypothetical protein  53.77 
 
 
109 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000285876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3578  hypothetical protein  53.77 
 
 
109 aa  106  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1574  hypothetical protein  52.83 
 
 
109 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1748  hypothetical protein  52.68 
 
 
115 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1622  hypothetical protein  56.7 
 
 
119 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0823  hypothetical protein  30.53 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2100  hypothetical protein  32.69 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1918  hypothetical protein  28.72 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.393175  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4986  hypothetical protein  28.97 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1782  hypothetical protein  30.43 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34032  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1797  hypothetical protein  39.34 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.0320282 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0567  hypothetical protein  37.7 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0857  hypothetical protein  29.59 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0446  hypothetical protein  35.94 
 
 
116 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.156414  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06048  hypothetical protein  30.23 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0041  hypothetical protein  32.79 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944894  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0044  hypothetical protein  32.79 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.185478  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0041  hypothetical protein  32.79 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0027  hypothetical protein  32.79 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000345558 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001367  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.34 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0420  hypothetical protein  28.24 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0359883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2175  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0892  hypothetical protein  34.43 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0173  hypothetical protein  29.59 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>