33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1797 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1797  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  225  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.0320282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0446  hypothetical protein  70.69 
 
 		 116 aa  170  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.156414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1782  hypothetical protein  62.07 
 
 		 116 aa  153  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4986  hypothetical protein  59.48 
 
 		 116 aa  149  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0420  hypothetical protein  55.45 
 
 		 116 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0359883  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1918  hypothetical protein  50.86 
 
 		 116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.393175  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0044  hypothetical protein  44.83 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.185478  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0041  hypothetical protein  44.83 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0041  hypothetical protein  44.83 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0027  hypothetical protein  44.83 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345558 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0567  hypothetical protein  43.97 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2100  hypothetical protein  35.34 
 
 		 116 aa  90.9  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4389  hypothetical protein  42.24 
 
 		 116 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487019 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06048  hypothetical protein  37.07 
 
 		 116 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001367  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  37.93 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0643  hypothetical protein  43.97 
 
 		 116 aa  84.3  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2175  hypothetical protein  44.83 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0892  hypothetical protein  46.55 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2024  hypothetical protein  44.12 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1833  hypothetical protein  44.12 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.128002  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3375  hypothetical protein  39.34 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000793072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1748  hypothetical protein  37.93 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1583  hypothetical protein  37.93 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000285876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1764  hypothetical protein  37.93 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1798  hypothetical protein  37.93 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1825  hypothetical protein  37.93 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1879  hypothetical protein  37.93 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1574  hypothetical protein  37.93 
 
 		 109 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1622  hypothetical protein  37.93 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3578  hypothetical protein  37.93 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1622  hypothetical protein  37.93 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.960168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1404  hypothetical protein  34.48 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.230162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>