35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001367 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001367  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  100 
 
 
116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06048  hypothetical protein  73.04 
 
 
116 aa  180  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0567  hypothetical protein  60 
 
 
116 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4389  hypothetical protein  62.61 
 
 
116 aa  147  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.487019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0027  hypothetical protein  58.26 
 
 
146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000345558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0041  hypothetical protein  58.26 
 
 
116 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0044  hypothetical protein  58.26 
 
 
116 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.185478  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0041  hypothetical protein  58.26 
 
 
116 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944894  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0643  hypothetical protein  59.13 
 
 
116 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2024  hypothetical protein  59.13 
 
 
117 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275367  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1833  hypothetical protein  58.26 
 
 
117 aa  114  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.128002  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1782  hypothetical protein  40.52 
 
 
116 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34032  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0446  hypothetical protein  45.69 
 
 
116 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.156414  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4986  hypothetical protein  40.52 
 
 
116 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1797  hypothetical protein  37.93 
 
 
116 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.0320282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0420  hypothetical protein  36.21 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0359883  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1918  hypothetical protein  31.03 
 
 
116 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.393175  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2100  hypothetical protein  34.55 
 
 
116 aa  76.6  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1346  hypothetical protein  61.29 
 
 
69 aa  60.5  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134019  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1622  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.960168  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2175  hypothetical protein  34.48 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3375  hypothetical protein  30.34 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000793072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1748  hypothetical protein  31.43 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1574  hypothetical protein  31.25 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1764  hypothetical protein  31.25 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0892  hypothetical protein  38.98 
 
 
116 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1583  hypothetical protein  31.25 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000285876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1622  hypothetical protein  31.25 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1825  hypothetical protein  31.25 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1879  hypothetical protein  31.25 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3578  hypothetical protein  31.25 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1798  hypothetical protein  31.25 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1404  hypothetical protein  27.59 
 
 
109 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.230162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0823  hypothetical protein  27.4 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2036  hypothetical protein  34.07 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.273141  normal  0.0525282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>