20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0892 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0892  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  213  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2100  hypothetical protein  45.69 
 
 		 116 aa  107  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1797  hypothetical protein  46.55 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.0320282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0446  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.156414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2175  hypothetical protein  60.34 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1782  hypothetical protein  43.1 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4986  hypothetical protein  44.64 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0420  hypothetical protein  41.38 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0359883  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1918  hypothetical protein  37.17 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.393175  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001367  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  34.55 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0027  hypothetical protein  36.36 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0041  hypothetical protein  36.36 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0041  hypothetical protein  36.36 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0044  hypothetical protein  36.36 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.185478  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0567  hypothetical protein  35.45 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4389  hypothetical protein  35.34 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487019 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06048  hypothetical protein  31.82 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0643  hypothetical protein  34.48 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0823  hypothetical protein  28.12 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3375  hypothetical protein  30.12 
 
 		 113 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000793072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>