26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3538 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3538  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  793    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1160  hypothetical protein  54.28 
 
 		 381 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0667195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0510  hypothetical protein  52.36 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000433382  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  32.69 
 
 		 1017 aa  53.1  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  26.8 
 
 		 1081 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  31.62 
 
 		 1024 aa  51.2  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  24.28 
 
 		 1074 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  26.8 
 
 		 1081 aa  50.4  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  25.64 
 
 		 898 aa  50.4  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0446  ResB family protein  22.76 
 
 		 605 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2870  hypothetical protein  20.07 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  26.29 
 
 		 1081 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  28.36 
 
 		 588 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  23.57 
 
 		 558 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  22.37 
 
 		 596 aa  46.6  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  25.24 
 
 		 1076 aa  46.6  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  28.57 
 
 		 576 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2770  hypothetical protein  34.86 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.636678  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1054 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  22.74 
 
 		 603 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  28.57 
 
 		 578 aa  43.5  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  30.48 
 
 		 1027 aa  43.1  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  24.09 
 
 		 572 aa  43.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  26.39 
 
 		 550 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  26.39 
 
 		 550 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  26.39 
 
 		 550 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>