118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2839 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2839  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 
55 aa  104  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  75.56 
 
 
66 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  61.54 
 
 
57 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  53.7 
 
 
56 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  64.44 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  57.14 
 
 
59 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  55.56 
 
 
60 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  51.92 
 
 
55 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1128  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 
55 aa  60.5  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3134  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.15 
 
 
55 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.98 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  51.85 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  55.56 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1290  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.08 
 
 
57 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  45.83 
 
 
87 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.31 
 
 
55 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  57.78 
 
 
67 aa  53.9  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
106 aa  53.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1201  twin arginine translocase protein A  67.31 
 
 
65 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  46.15 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  46.15 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  46.15 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  46.15 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.66 
 
 
113 aa  52  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.44 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
90 aa  51.6  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  47.73 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 
91 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  48.89 
 
 
104 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 
91 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3049  twin arginine translocase protein A  63.46 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.74 
 
 
58 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.74 
 
 
58 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.78 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.1 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2263  twin arginine translocase protein A  53.7 
 
 
57 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1959  twin arginine translocase protein A  53.7 
 
 
57 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2259  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.15 
 
 
62 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000334335  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.98 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  44.68 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  42.22 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  43.64 
 
 
60 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  34.43 
 
 
89 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.64 
 
 
96 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  45.83 
 
 
126 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  49.06 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  48.89 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  40.82 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.94 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.18 
 
 
214 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.94 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1046  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.6 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00953669 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.94 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3190  twin arginine-targeting protein translocase  50.98 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  36.73 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  40.82 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  48.78 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1117  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.86 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.22 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.67 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0289  twin arginine translocase protein A  49.06 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0132  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  51.11 
 
 
207 aa  44.7  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1896  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.67 
 
 
87 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0148  twin arginine translocase protein A  52.94 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001924  twin-arginine translocation protein TatA  42.86 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  38 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0593  twin arginine-targeting protein translocase  38.46 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0778682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3205  Sec-independent protein translocase protein TatA  36.54 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10686  Tat family transporter: pH-dependent thylakoid protein export into thylakoid  38.64 
 
 
55 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  34.69 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  34.69 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  42.11 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  36.73 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  39.62 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2379  twin arginine-targeting protein translocase  45.1 
 
 
55 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329124  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.78 
 
 
193 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4099  twin arginine-targeting protein translocase  39.62 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.966415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.9 
 
 
208 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  41.67 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  35.42 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  35.42 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3795  twin arginine-targeting protein translocase  35.71 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>