21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2611 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2611  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 94 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3387  DNA polymerase beta subunit  56.38 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2462  DNA polymerase, beta-like region  62.64 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0206  DNA polymerase, beta-like region  54.26 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2721  DNA polymerase, beta-like region  48.94 
 
 		 93 aa  92.8  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000295369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0242  DNA polymerase beta domain protein region  48.98 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0863  DNA polymerase beta subunit  42.42 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1818  hypothetical protein  39.6 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000143268  hitchhiker  0.0000000000225377 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1806  DNA polymerase beta domain protein region  39.8 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.897412  hitchhiker  0.0000000124073 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1467  hypothetical protein  39.58 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1147  DNA polymerase beta domain protein region  39.18 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1984  DNA polymerase beta subunit  37.25 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0151  hypothetical protein  41.67 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000205386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0646  DNA polymerase beta subunit  45.35 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1383  hypothetical protein  36.36 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0008  DNA polymerase beta domain protein region  39.8 
 
 		 97 aa  50.8  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3271  hypothetical protein  34.65 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0817  DNA polymerase beta subunit  34 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0233  DNA polymerase beta subunit  40.48 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  35.59 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0521  DNA polymerase beta domain protein region  54.29 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>