22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1806 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1806  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 100 aa  206  9e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.897412  hitchhiker  0.0000000124073 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0863  DNA polymerase beta subunit  62.63 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1984  DNA polymerase beta subunit  57.58 
 
 		 99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0646  DNA polymerase beta subunit  51.52 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0233  DNA polymerase beta subunit  46.46 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1818  hypothetical protein  50.5 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000143268  hitchhiker  0.0000000000225377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3271  hypothetical protein  49.02 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0151  hypothetical protein  48 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000205386  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0744  hypothetical protein  46.6 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0817  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1147  DNA polymerase beta domain protein region  34.34 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0008  DNA polymerase beta domain protein region  41.41 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0242  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1467  hypothetical protein  41.41 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2611  DNA polymerase beta domain protein region  39.8 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0206  DNA polymerase, beta-like region  39.08 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3387  DNA polymerase beta subunit  40.82 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2462  DNA polymerase, beta-like region  39.02 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2721  DNA polymerase, beta-like region  34 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000295369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0753  DNA polymerase beta subunit  33 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1383  hypothetical protein  51.06 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0521  DNA polymerase beta domain protein region  54.55 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>