20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0521 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0521  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
85 aa  174  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1383  hypothetical protein  53.57 
 
 
94 aa  103  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0817  DNA polymerase beta subunit  36.9 
 
 
100 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1818  hypothetical protein  34.52 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000143268  hitchhiker  0.0000000000225377 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0233  DNA polymerase beta subunit  39.74 
 
 
105 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1147  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1467  hypothetical protein  61.76 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0151  hypothetical protein  48.72 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000205386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2721  DNA polymerase, beta-like region  32.56 
 
 
93 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000295369  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0242  DNA polymerase beta domain protein region  34.21 
 
 
98 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0863  DNA polymerase beta subunit  52.78 
 
 
107 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1984  DNA polymerase beta subunit  45.95 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0008  DNA polymerase beta domain protein region  34.12 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2462  DNA polymerase, beta-like region  37.29 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1806  DNA polymerase beta domain protein region  54.55 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.897412  hitchhiker  0.0000000124073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0744  hypothetical protein  44.68 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3271  hypothetical protein  42.11 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0206  DNA polymerase, beta-like region  40.91 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0753  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2611  DNA polymerase beta domain protein region  54.29 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>