23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0817 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0817  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 
100 aa  199  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0863  DNA polymerase beta subunit  45 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1818  hypothetical protein  41.58 
 
 
101 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000143268  hitchhiker  0.0000000000225377 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0744  hypothetical protein  41.18 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0151  hypothetical protein  45.45 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000205386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1467  hypothetical protein  42 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3271  hypothetical protein  40.59 
 
 
101 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1806  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.897412  hitchhiker  0.0000000124073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1984  DNA polymerase beta subunit  41.58 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0008  DNA polymerase beta domain protein region  39 
 
 
97 aa  62.8  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0233  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0242  DNA polymerase beta domain protein region  40.59 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1147  DNA polymerase beta domain protein region  32.65 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0521  DNA polymerase beta domain protein region  36.9 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2721  DNA polymerase, beta-like region  38 
 
 
93 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000295369  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0269  DNA polymerase, beta domain protein region  42.65 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2462  DNA polymerase, beta-like region  37.11 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1383  hypothetical protein  36.14 
 
 
94 aa  51.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0753  DNA polymerase beta subunit  36.45 
 
 
112 aa  50.8  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0646  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2611  DNA polymerase beta domain protein region  34 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0206  DNA polymerase, beta-like region  35.48 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3387  DNA polymerase beta subunit  37.84 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>