22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0863 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0863  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 107 aa  206  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1984  DNA polymerase beta subunit  70.71 
 
 		 99 aa  136  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1806  DNA polymerase beta domain protein region  62.63 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.897412  hitchhiker  0.0000000124073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0646  DNA polymerase beta subunit  53 
 
 		 99 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0233  DNA polymerase beta subunit  48.08 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0817  DNA polymerase beta subunit  45 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1818  hypothetical protein  49.04 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000143268  hitchhiker  0.0000000000225377 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0744  hypothetical protein  46.15 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3271  hypothetical protein  44.55 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0206  DNA polymerase, beta-like region  39.33 
 
 		 93 aa  67  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1147  DNA polymerase beta domain protein region  38 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3387  DNA polymerase beta subunit  41.41 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2611  DNA polymerase beta domain protein region  42.42 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0242  DNA polymerase beta domain protein region  38.61 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0151  hypothetical protein  43 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000205386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2721  DNA polymerase, beta-like region  36.36 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000295369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0753  DNA polymerase beta subunit  38.61 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1467  hypothetical protein  40.2 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0008  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2462  DNA polymerase, beta-like region  38.78 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1383  hypothetical protein  48 
 
 		 94 aa  50.8  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0521  DNA polymerase beta domain protein region  52.78 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>