23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2721 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2721  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 93 aa  183  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000295369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3387  DNA polymerase beta subunit  48.39 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2462  DNA polymerase, beta-like region  50 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2611  DNA polymerase beta domain protein region  48.94 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0206  DNA polymerase, beta-like region  49.46 
 
 		 93 aa  87.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1984  DNA polymerase beta subunit  37.37 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0008  DNA polymerase beta domain protein region  42.71 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0242  DNA polymerase beta domain protein region  38.78 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0151  hypothetical protein  40.62 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000205386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1467  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0863  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1818  hypothetical protein  36.63 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000143268  hitchhiker  0.0000000000225377 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0744  hypothetical protein  33.02 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3271  hypothetical protein  35.64 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0233  DNA polymerase beta subunit  41.03 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1806  DNA polymerase beta domain protein region  34 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.897412  hitchhiker  0.0000000124073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0817  DNA polymerase beta subunit  38 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1383  hypothetical protein  31.58 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0521  DNA polymerase beta domain protein region  32.56 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0646  DNA polymerase beta subunit  39.78 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1147  DNA polymerase beta domain protein region  35.79 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0753  DNA polymerase beta subunit  28.16 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0269  DNA polymerase, beta domain protein region  32.14 
 
 		 90 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>