226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6955 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6955  AAA ATPase  100 
 
 		 373 aa  742    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2074  ATPase  41.71 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1601  AAA ATPase  50.84 
 
 		 335 aa  272  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1732  ATPase-like protein  41.46 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0797169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0437  AAA ATPase  45.43 
 
 		 332 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.493409  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3104  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.5 
 
 		 343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2133  ATPase-like protein  41.76 
 
 		 315 aa  255  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3882  AAA ATPase  43.16 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50535  normal  0.019718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4517  AAA ATPase central domain protein  44.94 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.460777 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4307  ATPase  38.11 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0507222  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2229  ATPase  38.17 
 
 		 381 aa  233  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0402  ATPase  42.48 
 
 		 385 aa  222  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.447843  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4467  AAA ATPase central domain protein  35.17 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179152  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2767  ATPase  34.03 
 
 		 311 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.313404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4254  ATPase protein  35.48 
 
 		 288 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1430  ATPase  33.33 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4638  ATPase  35.59 
 
 		 281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.10339 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0945  ATPase  33.2 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2134  ATPase  33.91 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00244059  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2653  AAA family ATPase  34.75 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0894  ATPase  33.9 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1311  ATPase  34.75 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2090  ATPase AAA_5  33.9 
 
 		 281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0794647  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1222  ATPase  32.78 
 
 		 286 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1191  ATPase  34.32 
 
 		 279 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0929  AAA ATPase central domain protein  32.82 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  0.607082 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0548  ATPase  32.99 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1788  ATPase  31.95 
 
 		 281 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2894  ATPase  33.05 
 
 		 289 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220244  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1661  ATPase  33.61 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2371  ATPase  32.82 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1094  ATPase, AAA family protein  34.44 
 
 		 284 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0108  ATPase  34.89 
 
 		 292 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0213616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2251  ATPase  32.82 
 
 		 280 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3984  hypothetical protein  32.63 
 
 		 281 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29130  ATPase  32.2 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3155  ATPase  33.9 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0864  AAA ATPase central domain protein  32.43 
 
 		 297 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125814  normal  0.499704 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1331  ATPase, AAA family protein  31.54 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00666024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4631  ATPase central domain-containing protein  35.04 
 
 		 283 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5094  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.04 
 
 		 283 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.2 
 
 		 280 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3873  ATPase  31.78 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0352016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5020  AAA ATPase central domain protein  33.73 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.422648  normal  0.019419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3298  hypothetical protein  34.93 
 
 		 281 aa  116  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1936  ATPase, AAA family protein  31.54 
 
 		 317 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1720  ATPase  33.05 
 
 		 286 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.501312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2638  ATPase  34.75 
 
 		 281 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2058  ATPase  28.77 
 
 		 277 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2332  ATPase  33.05 
 
 		 286 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2355  ATPase central domain-containing protein  33.05 
 
 		 286 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0849  ATPase, AAA family protein  31.54 
 
 		 317 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1170  AAA family ATPase  33.05 
 
 		 280 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2682  AAA_5 ATPase  33.47 
 
 		 285 aa  115  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0320361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0899  ATPase  30.9 
 
 		 360 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3556  ATPase central domain-containing protein  32.78 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.187416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1385  AAA ATPase central domain protein  33.05 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5674  AAA ATPase  33.05 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1589  AAA_5 ATPase  33.47 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.566046  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0299  ATPase, AAA family protein  33.05 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6260  ATPase  33.47 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4094  ATPase  31.8 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.271648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3952  ATPase central domain-containing protein  34.85 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1016  ATPase, AAA family protein  33.05 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1178  AAA family ATPase  33.05 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4573  AAA family ATPase  31.8 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0238067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0998  hypothetical protein  33.9 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1316  ATPase  31.8 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0965  ATPase, AAA family protein  33.05 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4138  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.32 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18588  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1940  ATPase central domain-containing protein  34.38 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2505  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.03 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0986  ATPase  32.63 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0906  ATPase  32.63 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.166593  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5168  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.04 
 
 		 283 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2541  ATPase  30.93 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104036  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3905  ATPase, AAA family  31.54 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.595065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1580  AAA ATPase, central region:AAA ATPase, central region  31.12 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.261649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1409  ATPase  30.93 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2516  ATPase  33.77 
 
 		 278 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.352302  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1945  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.2 
 
 		 360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.42736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32860  ATPase, AAA family protein  34.5 
 
 		 281 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1977  ATPase  32.9 
 
 		 294 aa  114  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2357  ATPase  32.37 
 
 		 284 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.797893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02167  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  32.63 
 
 		 278 aa  113  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1883  putative clpA/clpB family protein  33.47 
 
 		 280 aa  113  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406023  normal  0.307774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1910  ATPase  33.47 
 
 		 280 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0860  ATPase  33.2 
 
 		 280 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0809  ATPase  29.66 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652104  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1639  ATPase  32.92 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.435495  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0802  AAA family ATPase  29.31 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0517  AAA ATPase, central region:ATPase  30.61 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2122  ATPase  33.05 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787616  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1605  ATPase central domain-containing protein  32.2 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.863754  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1023  AAA ATPase, central region:ATPase  32.63 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58673  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7091  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.31 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158669  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.93 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62341 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3608  AAA ATPase central domain protein  29.28 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3315  putative ATPase, AAA family protein  30.51 
 
 		 280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3462  ATPase  33.05 
 
 		 280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0889695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>