227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2133 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2133  ATPase-like protein  100 
 
 
315 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170548  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2074  ATPase  52.15 
 
 
324 aa  322  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3104  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.52 
 
 
343 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1732  ATPase-like protein  47.25 
 
 
350 aa  291  8e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0797169  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1601  AAA ATPase  49.82 
 
 
335 aa  275  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4307  ATPase  46.13 
 
 
364 aa  274  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0507222  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0437  AAA ATPase  41.49 
 
 
332 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.493409  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2229  ATPase  43.63 
 
 
381 aa  256  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6955  AAA ATPase  41.76 
 
 
373 aa  255  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3882  AAA ATPase  39.6 
 
 
372 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50535  normal  0.019718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4517  AAA ATPase central domain protein  33.43 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.460777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0402  ATPase  40.45 
 
 
385 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.447843  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2767  ATPase  38.63 
 
 
311 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.313404  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4254  ATPase protein  37.8 
 
 
288 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2134  ATPase  41.4 
 
 
291 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00244059  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2653  AAA family ATPase  37.55 
 
 
279 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1311  ATPase  37.55 
 
 
279 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0548  ATPase  39.59 
 
 
279 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2682  AAA_5 ATPase  37.6 
 
 
285 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0320361  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0894  ATPase  37.29 
 
 
279 aa  142  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02167  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  35.11 
 
 
278 aa  142  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0906  ATPase  37.02 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.166593  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1191  ATPase  36.71 
 
 
279 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3556  ATPase central domain-containing protein  40.74 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.187416  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4638  ATPase  39.09 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.10339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1940  ATPase central domain-containing protein  35.48 
 
 
283 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.28 
 
 
280 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3155  ATPase  35.45 
 
 
284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2090  ATPase AAA_5  39.73 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0794647  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5168  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.07 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1720  ATPase  36.82 
 
 
286 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.501312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2355  ATPase central domain-containing protein  36.82 
 
 
286 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2332  ATPase  36.82 
 
 
286 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0864  AAA ATPase central domain protein  34.3 
 
 
297 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125814  normal  0.499704 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2357  ATPase  34.46 
 
 
284 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.797893  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4631  ATPase central domain-containing protein  37.45 
 
 
283 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5674  AAA ATPase  36.82 
 
 
280 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5094  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.45 
 
 
283 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2251  ATPase  36.4 
 
 
280 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4467  AAA ATPase central domain protein  39.27 
 
 
284 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0986  ATPase  35.47 
 
 
292 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2371  ATPase  36.4 
 
 
280 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0945  ATPase  36.4 
 
 
280 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3298  hypothetical protein  38.71 
 
 
281 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1883  putative clpA/clpB family protein  38.62 
 
 
280 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406023  normal  0.307774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0802  AAA family ATPase  33.46 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1589  AAA_5 ATPase  38.71 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.566046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2122  ATPase  39.81 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787616  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3462  ATPase  37.71 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0889695  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1430  ATPase  37.29 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1661  ATPase  38.99 
 
 
284 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2058  ATPase  38.14 
 
 
277 aa  136  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0809  ATPase  33.46 
 
 
284 aa  136  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652104  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1719  ATPase central domain-containing protein  34.47 
 
 
290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631647  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1023  AAA ATPase, central region:ATPase  34.72 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6260  ATPase  37.29 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7091  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.29 
 
 
281 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158669  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2101  ATPase  38.07 
 
 
280 aa  135  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.316568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.7 
 
 
280 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2516  ATPase  36.71 
 
 
278 aa  135  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.352302  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6213  ATPase  36.05 
 
 
281 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0860  ATPase  36.02 
 
 
280 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0965  ATPase, AAA family protein  35.56 
 
 
335 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2638  ATPase  40 
 
 
281 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858309  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5020  AAA ATPase central domain protein  38.01 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.422648  normal  0.019419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1222  ATPase  35.77 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1094  ATPase, AAA family protein  37.9 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3315  putative ATPase, AAA family protein  39.73 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492501  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4138  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.71 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18588  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1605  ATPase central domain-containing protein  39.35 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.863754  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1385  AAA ATPase central domain protein  37.56 
 
 
283 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1639  ATPase  37.9 
 
 
281 aa  133  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.435495  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1178  AAA family ATPase  37.44 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0517  AAA ATPase, central region:ATPase  35.17 
 
 
301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1170  AAA family ATPase  37.44 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1910  ATPase  38.43 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102293  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1408  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.25 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0929  AAA ATPase central domain protein  33.96 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  0.607082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1615  ATPase  31.83 
 
 
308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830139  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.25 
 
 
282 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3717  ATPase-like protein  40.35 
 
 
331 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1409  ATPase  37.1 
 
 
281 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0998  hypothetical protein  33.58 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451965  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3952  ATPase central domain-containing protein  34.33 
 
 
284 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32860  ATPase, AAA family protein  38.71 
 
 
281 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0299  ATPase, AAA family protein  37.44 
 
 
280 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1016  ATPase, AAA family protein  37.44 
 
 
280 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1936  ATPase, AAA family protein  36.7 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576346  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1331  ATPase, AAA family protein  36.7 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00666024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0108  ATPase  36.41 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0213616  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3608  AAA ATPase central domain protein  38.5 
 
 
289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0849  ATPase, AAA family protein  36.7 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1580  AAA ATPase, central region:AAA ATPase, central region  37.5 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.261649 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2541  ATPase  37.73 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104036  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1977  ATPase  36.99 
 
 
294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2236  ATPase central domain-containing protein  34.24 
 
 
279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3873  ATPase  35.78 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0352016  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1788  ATPase  38.81 
 
 
281 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0899  ATPase  37.22 
 
 
360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2505  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.49 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>