204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6709 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6709  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 352 aa  683    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1950  transposase, IS4  49.26 
 
 		 401 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2467  transposase, IS4  49.26 
 
 		 401 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1595  transposase IS4 family protein  36.59 
 
 		 483 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0392  transposase, IS4  36.73 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1119  transposase, IS4  36.73 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2121  transposase, IS4  36.73 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0994  transposase, IS4 family protein  34.54 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5311  putative transposase  30.65 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2810  transposase IS4 family protein  31.64 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5320  hypothetical protein  30.73 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2058  hypothetical protein  55.21 
 
 		 173 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00443479  normal  0.186203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6377  transposase IS4 family protein  31.1 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1108  transposase, IS4  27.98 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280026  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3990  transposase, IS4  29.7 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3073  transposase IS4 family protein  30.81 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0122  transposase, IS4  29.7 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0300  transposase, IS4  27.89 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0672  transposase, IS4  27.89 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1189  transposase, IS4  27.89 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.944159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1776  transposase, IS4  27.89 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1962  transposase, IS4  27.89 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2052  transposase, IS4  27.89 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.460189  normal  0.19863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2330  transposase, IS4  27.89 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2481  transposase, IS4  27.89 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650246  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2704  transposase, IS4  27.89 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2708  transposase, IS4  29.7 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2712  transposase, IS4  29.7 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2799  transposase, IS4  27.89 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2941  transposase, IS4  27.89 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3313  transposase, IS4  27.89 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4067  transposase, IS4  29.7 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4115  transposase, IS4  27.89 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4155  transposase, IS4  29.7 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.915026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4218  transposase, IS4  27.89 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.378092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4220  transposase, IS4  27.89 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0115  transposase, IS4  31.44 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4120  transposase, IS4  28.24 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2581  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0738  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136372 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1208  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580932  hitchhiker  0.00000329494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1128  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.588687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2131  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0176803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2180  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000540383 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0946  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2331  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.616307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2773  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2788  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2395  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1487  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2797  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2134  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0202334 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2427  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.383044  hitchhiker  0.00036202 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1512  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1765  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1510  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2080  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0309  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0471635  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0119  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0149  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0202  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0303  hypothetical protein  32.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0682855  hitchhiker  0.000916008 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3188  hypothetical protein  32.02 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0815564  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0277  ISPg2, transposase  25.52 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0865  ISPg2, transposase  25.52 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00233065 
 
 
-
 
NC_002950  PG1350  ISPg2, transposase  25.52 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1746  ISPg2, transposase  25.52 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2176  ISPg2, transposase  25.52 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1030  hypothetical protein  31.46 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2426  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.67588  hitchhiker  0.000659756 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0945  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0262  putative transposase, IS4 family  22.19 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.400165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0737  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2396  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2130  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0125473 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2135  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0139526 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2181  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000268633 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1127  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.418857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2772  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2798  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2580  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2789  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1209  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000367685 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1511  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.673335  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2330  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1766  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.398767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2081  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01923  transposase  23.74 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0118  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0150  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0201  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0304  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0856099  hitchhiker  0.00019889 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0308  transposase, IS4  38 
 
 		 104 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00145188  decreased coverage  0.0000198477 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3781  transposase IS4 family protein  26.33 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0246  transposase, IS4 family protein  21.84 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0296  transposase IS4 family protein  25.82 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0443  transposase IS4 family protein  25.82 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0569  transposase IS4 family protein  25.82 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.228181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0572  transposase IS4 family protein  25.82 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0597  transposase IS4 family protein  25.82 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.818291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>