266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6377 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2810  transposase IS4 family protein  98.99 
 
 
395 aa  801    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3073  transposase IS4 family protein  99.17 
 
 
367 aa  736    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6377  transposase IS4 family protein  100 
 
 
395 aa  808    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4120  transposase, IS4  61.04 
 
 
390 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0994  transposase, IS4 family protein  37.9 
 
 
395 aa  172  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5320  hypothetical protein  33.25 
 
 
437 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621577  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0672  transposase, IS4  34.01 
 
 
433 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1189  transposase, IS4  34.01 
 
 
433 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.944159  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1776  transposase, IS4  34.01 
 
 
433 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1962  transposase, IS4  34.01 
 
 
433 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2052  transposase, IS4  34.01 
 
 
433 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.460189  normal  0.19863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2330  transposase, IS4  34.01 
 
 
433 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2481  transposase, IS4  34.01 
 
 
433 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650246  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2704  transposase, IS4  34.01 
 
 
433 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2799  transposase, IS4  34.01 
 
 
433 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2941  transposase, IS4  34.01 
 
 
433 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3313  transposase, IS4  34.01 
 
 
433 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4115  transposase, IS4  34.01 
 
 
433 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4218  transposase, IS4  34.01 
 
 
433 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.378092  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4220  transposase, IS4  34.01 
 
 
433 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0300  transposase, IS4  34.01 
 
 
409 aa  159  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0392  transposase, IS4  36.36 
 
 
390 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1119  transposase, IS4  36.36 
 
 
390 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2121  transposase, IS4  36.36 
 
 
390 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5311  putative transposase  30.88 
 
 
415 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1595  transposase IS4 family protein  31.59 
 
 
483 aa  131  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0793  transposase, IS4 family protein  29.46 
 
 
374 aa  125  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.980671  hitchhiker  0.00200934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0786  transposase, IS4 family protein  28.61 
 
 
374 aa  119  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0609195  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  28.61 
 
 
374 aa  120  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  28.61 
 
 
374 aa  119  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1108  transposase, IS4  30.35 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280026  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0122  transposase, IS4  30.56 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2708  transposase, IS4  30.56 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2712  transposase, IS4  30.56 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4067  transposase, IS4  30.56 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4155  transposase, IS4  30.56 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.915026  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3990  transposase, IS4  30.56 
 
 
396 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2180  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000540383 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2080  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111735  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2395  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0303  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0682855  hitchhiker  0.000916008 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0738  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136372 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1128  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.588687  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0946  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0309  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0471635  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1208  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580932  hitchhiker  0.00000329494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2581  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0119  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2131  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0176803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0149  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1487  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431301  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1765  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1512  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1510  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0202  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2773  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2788  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896151  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2331  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.616307  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2797  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2134  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0202334 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2427  hypothetical protein  38.43 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.383044  hitchhiker  0.00036202 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0257  ISEc3, transposase  28.06 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.893846 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01670  hypothetical protein  28.7 
 
 
373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3151  transposase IS4 family protein  29.95 
 
 
372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683111  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0486  transposase IS4 family protein  29.95 
 
 
372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2203  transposase IS4 family protein  27.69 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000366545  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3781  transposase IS4 family protein  29.52 
 
 
372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0796  ISEc4, transposase  27.81 
 
 
378 aa  113  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.699242  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2950  transposase IS4 family protein  27.69 
 
 
378 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2129  transposase, putative  26.84 
 
 
373 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2187  transposase IS4 family protein  27.66 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00361348  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3805  transposase IS4 family protein  28.68 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0583  ISEc3, transposase  27.44 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2901  transposase IS4 family protein  29.7 
 
 
381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.180142  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0115  transposase, IS4  36.04 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0027  transposase IS4 family protein  29.7 
 
 
381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2703  transposase IS4 family protein  29.7 
 
 
381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00213  predicted transposase  27.41 
 
 
378 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00217  hypothetical protein  27.41 
 
 
378 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0336  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401127  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1781  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3914  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5084  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3776  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2179  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0083  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0627718 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3009  transposase  27.52 
 
 
370 aa  110  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0643  ISEc4, transposase  27.18 
 
 
378 aa  110  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.852316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03334  predicted transposase  27.18 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0230  transposase IS4 family protein  27.18 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03286  hypothetical protein  27.18 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1950  transposase, IS4  29.69 
 
 
401 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143043  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2467  transposase, IS4  29.69 
 
 
401 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  26.53 
 
 
377 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0598  transposase, IS4  27.35 
 
 
374 aa  107  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3082  transposase IS4 family protein  26.92 
 
 
378 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4211  transposase, IS4  34.23 
 
 
310 aa  106  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  26.28 
 
 
377 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2439  transposase, IS4  27.37 
 
 
374 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2176  ISPg2, transposase  27.3 
 
 
376 aa  103  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>