269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4120 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4120  transposase, IS4  100 
 
 		 390 aa  804    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2810  transposase IS4 family protein  61.3 
 
 		 395 aa  485  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6377  transposase IS4 family protein  61.04 
 
 		 395 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3073  transposase IS4 family protein  60.51 
 
 		 367 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0994  transposase, IS4 family protein  36.73 
 
 		 395 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0300  transposase, IS4  32.99 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0672  transposase, IS4  32.99 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1189  transposase, IS4  32.99 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.944159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1776  transposase, IS4  32.99 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1962  transposase, IS4  32.99 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2052  transposase, IS4  32.99 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.460189  normal  0.19863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2330  transposase, IS4  32.99 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2481  transposase, IS4  32.99 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650246  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2704  transposase, IS4  32.99 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2799  transposase, IS4  32.99 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2941  transposase, IS4  32.99 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3313  transposase, IS4  32.99 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4115  transposase, IS4  32.99 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4218  transposase, IS4  32.99 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.378092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4220  transposase, IS4  32.99 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5320  hypothetical protein  31.74 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0392  transposase, IS4  34.18 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1119  transposase, IS4  34.18 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2121  transposase, IS4  34.18 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5311  putative transposase  30.13 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1108  transposase, IS4  30.58 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280026  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1512  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0119  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0202  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0309  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0471635  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0303  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0682855  hitchhiker  0.000916008 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0149  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0738  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136372 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2131  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0176803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1208  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580932  hitchhiker  0.00000329494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2788  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2581  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1510  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2797  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1765  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2773  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1487  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0946  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1128  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.588687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2134  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0202334 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2331  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.616307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2080  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2180  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000540383 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2395  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2427  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.383044  hitchhiker  0.00036202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0115  transposase, IS4  35.34 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3805  transposase IS4 family protein  28.61 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3781  transposase IS4 family protein  28.77 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3151  transposase IS4 family protein  28.05 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683111  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0486  transposase IS4 family protein  28.05 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2187  transposase IS4 family protein  28.24 
 
 		 378 aa  117  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00361348  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01670  hypothetical protein  29.03 
 
 		 373 aa  116  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3009  transposase  28.25 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1595  transposase IS4 family protein  29.29 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0643  ISEc4, transposase  28.3 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.852316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0583  ISEc3, transposase  28.03 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  25.96 
 
 		 377 aa  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0122  transposase, IS4  29.26 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2708  transposase, IS4  29.26 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2712  transposase, IS4  29.26 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4067  transposase, IS4  29.26 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4155  transposase, IS4  29.26 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.915026  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00213  predicted transposase  28.57 
 
 		 378 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00217  hypothetical protein  28.57 
 
 		 378 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1950  transposase, IS4  28.26 
 
 		 401 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2467  transposase, IS4  28.26 
 
 		 401 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3990  transposase, IS4  29.26 
 
 		 396 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2203  transposase IS4 family protein  28.03 
 
 		 378 aa  112  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000366545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2129  transposase, putative  26.33 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2950  transposase IS4 family protein  28.03 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  25.52 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0598  transposase, IS4  28.57 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0257  ISEc3, transposase  27.1 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.893846 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03286  hypothetical protein  27.49 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03334  predicted transposase  27.49 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0230  transposase IS4 family protein  27.49 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0793  transposase, IS4 family protein  25 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.980671  hitchhiker  0.00200934 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3082  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0796  ISEc4, transposase  26.83 
 
 		 378 aa  106  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.699242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2439  transposase, IS4  28.21 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0477  transposase, IS4  28.72 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1172  transposase, IS4  28.72 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2671  hypothetical protein  68.75 
 
 		 209 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0786  transposase, IS4 family protein  24.72 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0609195  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  24.72 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5670  transposase ISAs1 family protein  25.14 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5660  transposase ISAs1 family protein  27.4 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315532 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  24.44 
 
 		 374 aa  102  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0336  transposase IS4 family protein  26.96 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401127  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3482  transposase, IS4 family protein  29.7 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.249116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2179  transposase IS4 family protein  26.96 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0083  transposase IS4 family protein  26.96 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0627718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3914  transposase IS4 family protein  26.96 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1781  transposase IS4 family protein  26.96 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3776  transposase IS4 family protein  26.96 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>