214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2058 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2058  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  339  9e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00443479  normal  0.186203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0392  transposase, IS4  71.3 
 
 		 390 aa  160  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1119  transposase, IS4  71.3 
 
 		 390 aa  160  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2121  transposase, IS4  71.3 
 
 		 390 aa  160  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0994  transposase, IS4 family protein  54.84 
 
 		 395 aa  97.4  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1595  transposase IS4 family protein  56.18 
 
 		 483 aa  94.7  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0672  transposase, IS4  52.5 
 
 		 433 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1189  transposase, IS4  52.5 
 
 		 433 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.944159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1776  transposase, IS4  52.5 
 
 		 433 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1962  transposase, IS4  52.5 
 
 		 433 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2052  transposase, IS4  52.5 
 
 		 433 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.460189  normal  0.19863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2330  transposase, IS4  52.5 
 
 		 433 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2481  transposase, IS4  52.5 
 
 		 433 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650246  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2704  transposase, IS4  52.5 
 
 		 433 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2799  transposase, IS4  52.5 
 
 		 433 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2941  transposase, IS4  52.5 
 
 		 433 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3313  transposase, IS4  52.5 
 
 		 433 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4115  transposase, IS4  52.5 
 
 		 433 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4218  transposase, IS4  52.5 
 
 		 433 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.378092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4220  transposase, IS4  52.5 
 
 		 433 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0300  transposase, IS4  52.5 
 
 		 409 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6709  transposase, IS4 family protein  54.17 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2580  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2396  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2181  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000268633 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2135  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0139526 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2130  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0125473 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2330  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1766  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.398767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2789  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1511  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.673335  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2798  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2426  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.67588  hitchhiker  0.000659756 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1209  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000367685 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2772  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2081  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0118  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0150  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0201  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0304  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0856099  hitchhiker  0.00019889 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0308  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00145188  decreased coverage  0.0000198477 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0737  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0945  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1127  transposase, IS4  47.19 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.418857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2810  transposase IS4 family protein  38.46 
 
 		 395 aa  70.9  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1108  transposase, IS4  41.57 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280026  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1950  transposase, IS4  46.81 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2467  transposase, IS4  46.81 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5311  putative transposase  39.62 
 
 		 415 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5320  hypothetical protein  39.62 
 
 		 437 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6377  transposase IS4 family protein  37.36 
 
 		 395 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4211  transposase, IS4  45.78 
 
 		 310 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4877  H repeat-containing protein  40.54 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2993  H repeat-containing protein  40.54 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.937922  normal  0.482071 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3482  transposase, IS4 family protein  37.36 
 
 		 327 aa  61.6  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.249116  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4120  transposase, IS4  38.89 
 
 		 390 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01923  transposase  40 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3781  transposase IS4 family protein  47.27 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3126  hypothetical protein  51.61 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3805  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 		 372 aa  58.2  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3073  transposase IS4 family protein  39.39 
 
 		 367 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3151  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 		 372 aa  57.8  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683111  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5670  transposase ISAs1 family protein  39.39 
 
 		 393 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0486  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 		 372 aa  57.8  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1610  ISMca6, transposase, OrfB  46.05 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3310  ISMca6, transposase, OrfB  43.94 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0122  transposase, IS4  39.47 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2708  transposase, IS4  39.47 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2712  transposase, IS4  39.47 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3990  transposase, IS4  39.47 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4067  transposase, IS4  39.47 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4155  transposase, IS4  39.47 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.915026  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0032  ISMca6, transposase, OrfB  46.05 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0262  putative transposase, IS4 family  35.21 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.400165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5660  transposase ISAs1 family protein  36.36 
 
 		 333 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2671  hypothetical protein  41.07 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2703  transposase IS4 family protein  34.21 
 
 		 381 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2901  transposase IS4 family protein  34.21 
 
 		 381 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.180142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0027  transposase IS4 family protein  34.21 
 
 		 381 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1741  IS4 family transposase  36 
 
 		 381 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2070  transposase, IS4  44.44 
 
 		 369 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2179  transposase IS4 family protein  44.64 
 
 		 388 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3776  transposase IS4 family protein  44.64 
 
 		 388 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1781  transposase IS4 family protein  44.64 
 
 		 388 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3914  transposase IS4 family protein  44.64 
 
 		 388 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5084  transposase IS4 family protein  44.64 
 
 		 388 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0282093 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  33.77 
 
 		 377 aa  52  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0083  transposase IS4 family protein  44.64 
 
 		 388 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0627718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0336  transposase IS4 family protein  44.64 
 
 		 388 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401127  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  33.77 
 
 		 377 aa  51.6  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03334  predicted transposase  41.67 
 
 		 378 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0230  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 		 378 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2187  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 		 378 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00361348  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1061  ISPg6, transposase  33.71 
 
 		 362 aa  51.6  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0257  ISEc3, transposase  41.67 
 
 		 378 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.893846 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03286  hypothetical protein  41.67 
 
 		 378 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0583  ISEc3, transposase  41.67 
 
 		 378 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2203  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 		 378 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000366545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2950  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 		 378 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0643  ISEc4, transposase  41.67 
 
 		 378 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.852316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>