270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0994 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0994  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
395 aa  786    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0392  transposase, IS4  50.54 
 
 
390 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1119  transposase, IS4  50.54 
 
 
390 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2121  transposase, IS4  50.54 
 
 
390 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0300  transposase, IS4  45.85 
 
 
409 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0672  transposase, IS4  45.85 
 
 
433 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1189  transposase, IS4  45.85 
 
 
433 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.944159  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1776  transposase, IS4  45.85 
 
 
433 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1962  transposase, IS4  45.85 
 
 
433 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2052  transposase, IS4  45.85 
 
 
433 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.460189  normal  0.19863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2330  transposase, IS4  45.85 
 
 
433 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2481  transposase, IS4  45.85 
 
 
433 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650246  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2704  transposase, IS4  45.85 
 
 
433 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2799  transposase, IS4  45.85 
 
 
433 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2941  transposase, IS4  45.85 
 
 
433 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3313  transposase, IS4  45.85 
 
 
433 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4115  transposase, IS4  45.85 
 
 
433 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4218  transposase, IS4  45.85 
 
 
433 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.378092  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4220  transposase, IS4  45.85 
 
 
433 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1108  transposase, IS4  43.05 
 
 
404 aa  237  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280026  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5320  hypothetical protein  38.44 
 
 
437 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621577  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0122  transposase, IS4  41.85 
 
 
396 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2708  transposase, IS4  41.85 
 
 
396 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2712  transposase, IS4  41.85 
 
 
396 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3990  transposase, IS4  41.85 
 
 
396 aa  210  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4067  transposase, IS4  41.85 
 
 
396 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4155  transposase, IS4  41.85 
 
 
396 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.915026  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5311  putative transposase  36.52 
 
 
415 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2810  transposase IS4 family protein  38.44 
 
 
395 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4120  transposase, IS4  36.73 
 
 
390 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6377  transposase IS4 family protein  37.9 
 
 
395 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3073  transposase IS4 family protein  38.48 
 
 
367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1950  transposase, IS4  35.88 
 
 
401 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143043  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2467  transposase, IS4  35.88 
 
 
401 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0115  transposase, IS4  45.19 
 
 
331 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1595  transposase IS4 family protein  35.62 
 
 
483 aa  164  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0309  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0471635  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2427  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.383044  hitchhiker  0.00036202 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0738  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136372 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2134  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0202334 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1128  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.588687  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1487  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431301  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1510  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1512  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1208  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580932  hitchhiker  0.00000329494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1765  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2773  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2797  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2180  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000540383 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0303  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0682855  hitchhiker  0.000916008 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2080  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111735  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0119  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2331  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.616307  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0202  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2788  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896151  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2131  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0176803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2581  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0149  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0946  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2395  hypothetical protein  44.86 
 
 
439 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4211  transposase, IS4  39.26 
 
 
310 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3805  transposase IS4 family protein  31.68 
 
 
372 aa  142  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3151  transposase IS4 family protein  31.4 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683111  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0486  transposase IS4 family protein  31.4 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0793  transposase, IS4 family protein  29.43 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.980671  hitchhiker  0.00200934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0786  transposase, IS4 family protein  28.91 
 
 
374 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0609195  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  28.91 
 
 
374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0262  putative transposase, IS4 family  30.11 
 
 
390 aa  139  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.400165  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  28.91 
 
 
374 aa  139  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3781  transposase IS4 family protein  31.13 
 
 
372 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6709  transposase, IS4 family protein  33.61 
 
 
352 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  26.27 
 
 
377 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0027  transposase IS4 family protein  31.4 
 
 
381 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2703  transposase IS4 family protein  31.4 
 
 
381 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2901  transposase IS4 family protein  31.4 
 
 
381 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.180142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  26.27 
 
 
377 aa  126  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0277  ISPg2, transposase  29.12 
 
 
376 aa  126  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0865  ISPg2, transposase  29.12 
 
 
376 aa  126  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00233065 
 
 
-
 
NC_002950  PG1350  ISPg2, transposase  29.12 
 
 
376 aa  126  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1746  ISPg2, transposase  29.12 
 
 
376 aa  126  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2176  ISPg2, transposase  29.12 
 
 
376 aa  126  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0583  ISEc3, transposase  27.49 
 
 
378 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0643  ISEc4, transposase  27.76 
 
 
378 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.852316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2187  transposase IS4 family protein  27.08 
 
 
378 aa  123  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00361348  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00213  predicted transposase  27.08 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2950  transposase IS4 family protein  27.08 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2203  transposase IS4 family protein  27.08 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000366545  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00217  hypothetical protein  27.08 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
366 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1656  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
366 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.882664  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0626  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
366 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0621  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
366 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4179  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
366 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3614  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
366 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0292  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
366 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0594  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
366 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
366 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1183  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
366 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0550  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
366 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0257  ISEc3, transposase  27.08 
 
 
378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.893846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>