28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4974 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4974  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  186  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  87.64 
 
 		 443 aa  171  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  85.23 
 
 		 443 aa  163  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  62.71 
 
 		 426 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  61.67 
 
 		 567 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  38.64 
 
 		 512 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  45.1 
 
 		 480 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  45.1 
 
 		 480 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  45.1 
 
 		 480 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  45.83 
 
 		 427 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  36.54 
 
 		 748 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  41.51 
 
 		 539 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  32.14 
 
 		 510 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3616  HNH endonuclease  44.23 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 434 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  43.14 
 
 		 602 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  46.3 
 
 		 519 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  34.83 
 
 		 714 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  38.6 
 
 		 593 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  38.6 
 
 		 578 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  38.6 
 
 		 581 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  38.6 
 
 		 593 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  38.6 
 
 		 581 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  46.3 
 
 		 550 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  42.5 
 
 		 637 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  36.84 
 
 		 578 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  41.07 
 
 		 517 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  41.07 
 
 		 524 aa  40  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>