115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3126 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3126  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0115  transposase, IS4  73.64 
 
 
331 aa  131  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0392  transposase, IS4  47.62 
 
 
390 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1119  transposase, IS4  47.62 
 
 
390 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2121  transposase, IS4  47.62 
 
 
390 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1108  transposase, IS4  44.44 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280026  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0122  transposase, IS4  34.3 
 
 
396 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2708  transposase, IS4  34.3 
 
 
396 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2712  transposase, IS4  34.3 
 
 
396 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3990  transposase, IS4  34.3 
 
 
396 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4067  transposase, IS4  34.3 
 
 
396 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4155  transposase, IS4  34.3 
 
 
396 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.915026  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0994  transposase, IS4 family protein  42.16 
 
 
395 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5311  putative transposase  40.2 
 
 
415 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5320  hypothetical protein  40.2 
 
 
437 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621577  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2058  hypothetical protein  51.61 
 
 
173 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00443479  normal  0.186203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1595  transposase IS4 family protein  34.92 
 
 
483 aa  58.9  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0300  transposase, IS4  35.63 
 
 
409 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0672  transposase, IS4  35.63 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1189  transposase, IS4  35.63 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.944159  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1776  transposase, IS4  35.63 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1962  transposase, IS4  35.63 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2052  transposase, IS4  35.63 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.460189  normal  0.19863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2330  transposase, IS4  35.63 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2481  transposase, IS4  35.63 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650246  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2704  transposase, IS4  35.63 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2799  transposase, IS4  35.63 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2941  transposase, IS4  35.63 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3313  transposase, IS4  35.63 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4115  transposase, IS4  35.63 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4218  transposase, IS4  35.63 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.378092  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4220  transposase, IS4  35.63 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1950  transposase, IS4  38.24 
 
 
401 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143043  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2467  transposase, IS4  38.24 
 
 
401 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4211  transposase, IS4  45.83 
 
 
310 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6709  transposase, IS4 family protein  35.37 
 
 
352 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0593  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
287 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.778481 
 
 
-
 
NC_002950  PG1061  ISPg6, transposase  38.57 
 
 
362 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179104 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0296  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0443  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0564  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.561014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0569  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.228181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0572  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0589  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0597  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0098  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0101  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0170  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0172  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0548  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0595  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0603  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0630  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0643  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0766  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0994  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.416705  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1228  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1271  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1300  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.406544  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1398  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2329  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102713  hitchhiker  0.000965394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2564  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000012164  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2609  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.720943  hitchhiker  0.00290124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2785  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.738177  normal  0.743727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3014  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3220  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3256  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0156341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3394  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.750621  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3592  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3606  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3866  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000448202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4087  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4106  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4172  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4396  transposase IS4 family protein  48.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  normal  0.0139807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2126  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.537555 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1989  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0275815  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1729  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1967  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0519059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1696  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0465835  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2192  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3409  hypothetical protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3025  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2411  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0186  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0568  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0649979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0630  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0635  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.124788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0641  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0808  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0989  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1035  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0517087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1099  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1605  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0244388  normal  0.0207285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1632  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
363 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2914  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 
378 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000104805  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1741  hypothetical protein  27.78 
 
 
366 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796927  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5649  transposase ISAs1 family protein  35.21 
 
 
377 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345672 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3492  hypothetical protein  27.78 
 
 
375 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0121  hypothetical protein  27.78 
 
 
375 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.474762  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>