37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2233 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2233  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  340  7e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.013098  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1903  hypothetical protein  84.8 
 
 
171 aa  297  5e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00831928  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5402  hypothetical protein  46.02 
 
 
188 aa  144  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2320  hypothetical protein  48.11 
 
 
192 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5933  hypothetical protein  45.76 
 
 
191 aa  140  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170867  normal  0.0304187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2284  hypothetical protein  45.11 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000012834  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2644  hypothetical protein  47.09 
 
 
180 aa  136  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.541155  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1935  hypothetical protein  44.63 
 
 
185 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0159683  normal  0.281098 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1834  hypothetical protein  46.07 
 
 
182 aa  134  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2166  hypothetical protein  44.44 
 
 
196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0132196  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2759  hypothetical protein  43.01 
 
 
193 aa  131  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1836  hypothetical protein  47.78 
 
 
188 aa  130  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0618344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3168  hypothetical protein  40.46 
 
 
195 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.781227  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3156  hypothetical protein  40.46 
 
 
195 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3481  hypothetical protein  41.04 
 
 
194 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0667912  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3218  hypothetical protein  40.46 
 
 
195 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2440  hypothetical protein  39.31 
 
 
238 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780198  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3045  hypothetical protein  40.46 
 
 
194 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.863407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12164  hypothetical protein  41.62 
 
 
195 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.359092  normal  0.52215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19820  hypothetical protein  44.83 
 
 
192 aa  127  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2138  hypothetical protein  40.8 
 
 
193 aa  125  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3452  hypothetical protein  44 
 
 
188 aa  124  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000423316  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2777  hypothetical protein  40.34 
 
 
186 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000457208  hitchhiker  0.0000488481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2626  hypothetical protein  41.01 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2664  hypothetical protein  46.33 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1170  hypothetical protein  40.11 
 
 
190 aa  114  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.893876  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26350  hypothetical protein  39.31 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200515  normal  0.0554048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2102  hypothetical protein  37.57 
 
 
183 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4253  hypothetical protein  34.68 
 
 
170 aa  101  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0007  hypothetical protein  34.48 
 
 
172 aa  98.2  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0351205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1693  hypothetical protein  38.15 
 
 
175 aa  96.3  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0111  hypothetical protein  35.84 
 
 
179 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.244009  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1954  hypothetical protein  36.78 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0264917  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16020  hypothetical protein  37.13 
 
 
180 aa  90.5  9e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0259  hypothetical protein  36.87 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.190998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3401  hypothetical protein  28.35 
 
 
200 aa  61.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0754  hypothetical protein  29.59 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>