37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1903 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1903  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  342  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00831928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2233  hypothetical protein  84.8 
 
 		 171 aa  297  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.013098  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5933  hypothetical protein  48.02 
 
 		 191 aa  141  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170867  normal  0.0304187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2320  hypothetical protein  47.54 
 
 		 192 aa  140  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5402  hypothetical protein  44.89 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2440  hypothetical protein  41.95 
 
 		 238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780198  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1935  hypothetical protein  47.46 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0159683  normal  0.281098 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3156  hypothetical protein  42.53 
 
 		 195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196949  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3218  hypothetical protein  42.53 
 
 		 195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3168  hypothetical protein  42.53 
 
 		 195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.781227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2284  hypothetical protein  45.2 
 
 		 186 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000012834  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3481  hypothetical protein  42.53 
 
 		 194 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0667912  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3045  hypothetical protein  42.53 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.863407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12164  hypothetical protein  42.53 
 
 		 195 aa  134  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.359092  normal  0.52215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2644  hypothetical protein  45.98 
 
 		 180 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.541155  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2166  hypothetical protein  45.45 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0132196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2777  hypothetical protein  43.68 
 
 		 186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000457208  hitchhiker  0.0000488481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2759  hypothetical protein  45.16 
 
 		 193 aa  130  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2138  hypothetical protein  43.43 
 
 		 193 aa  130  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19820  hypothetical protein  45.71 
 
 		 192 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1834  hypothetical protein  46.07 
 
 		 182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1836  hypothetical protein  48.89 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0618344  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3452  hypothetical protein  43.43 
 
 		 188 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000423316  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2626  hypothetical protein  44.38 
 
 		 191 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2664  hypothetical protein  46.86 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1170  hypothetical protein  42.94 
 
 		 190 aa  117  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.893876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26350  hypothetical protein  37.85 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200515  normal  0.0554048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2102  hypothetical protein  37.21 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4253  hypothetical protein  35.12 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1954  hypothetical protein  36.57 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0264917  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0111  hypothetical protein  37.57 
 
 		 179 aa  98.6  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.244009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0007  hypothetical protein  33.93 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1693  hypothetical protein  36.84 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16020  hypothetical protein  37.28 
 
 		 180 aa  87.4  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0259  hypothetical protein  35.2 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.190998  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0754  hypothetical protein  29.05 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3401  hypothetical protein  25.77 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>