37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5402 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5402  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  374  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2284  hypothetical protein  61.54 
 
 
186 aa  217  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000012834  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1935  hypothetical protein  57.22 
 
 
185 aa  204  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0159683  normal  0.281098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1170  hypothetical protein  59.46 
 
 
190 aa  201  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.893876  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5933  hypothetical protein  56.99 
 
 
191 aa  201  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170867  normal  0.0304187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2626  hypothetical protein  55.19 
 
 
191 aa  194  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1834  hypothetical protein  61.88 
 
 
182 aa  188  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12164  hypothetical protein  53.48 
 
 
195 aa  181  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.359092  normal  0.52215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3045  hypothetical protein  53.44 
 
 
194 aa  180  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.863407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3168  hypothetical protein  51.85 
 
 
195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.781227  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3218  hypothetical protein  51.85 
 
 
195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3156  hypothetical protein  51.85 
 
 
195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3481  hypothetical protein  51.85 
 
 
194 aa  177  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0667912  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2440  hypothetical protein  50.53 
 
 
238 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780198  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2777  hypothetical protein  50.53 
 
 
186 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000457208  hitchhiker  0.0000488481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1836  hypothetical protein  57.84 
 
 
188 aa  174  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0618344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2138  hypothetical protein  52.41 
 
 
193 aa  174  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3452  hypothetical protein  54.84 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000423316  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2759  hypothetical protein  54.74 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19820  hypothetical protein  54.26 
 
 
192 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2644  hypothetical protein  52.43 
 
 
180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.541155  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2664  hypothetical protein  59.04 
 
 
183 aa  160  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2320  hypothetical protein  51.79 
 
 
192 aa  159  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2102  hypothetical protein  48.24 
 
 
183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2166  hypothetical protein  47.24 
 
 
196 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0132196  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1954  hypothetical protein  45.66 
 
 
183 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0264917  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26350  hypothetical protein  42.78 
 
 
184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200515  normal  0.0554048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2233  hypothetical protein  46.02 
 
 
171 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.013098  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1903  hypothetical protein  44.89 
 
 
171 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00831928  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0111  hypothetical protein  49.41 
 
 
179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.244009  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16020  hypothetical protein  45.14 
 
 
180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1693  hypothetical protein  38.25 
 
 
175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0007  hypothetical protein  35.36 
 
 
172 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0351205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4253  hypothetical protein  33.7 
 
 
170 aa  101  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3401  hypothetical protein  34.65 
 
 
200 aa  95.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0259  hypothetical protein  36.41 
 
 
167 aa  90.1  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.190998  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0754  hypothetical protein  31.44 
 
 
184 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>