14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1888 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1888  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2379  hypothetical protein  47.06 
 
 
129 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.148037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3760  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  47.11 
 
 
146 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.410274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0496  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  42.34 
 
 
158 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000180452  decreased coverage  0.000517755 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0389  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  67  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000389815  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4773  hypothetical protein  31.09 
 
 
126 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50804  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0294  hypothetical protein  49.25 
 
 
146 aa  60.1  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1541  hypothetical protein  43.12 
 
 
123 aa  59.3  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.337603  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07030  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.516082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2924  hypothetical protein  55.36 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.018663  normal  0.0109649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0052  hypothetical protein  30.85 
 
 
154 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455768  normal  0.402924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24720  hypothetical protein  43.48 
 
 
111 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2426  Protein of unknown function DUF2166  30.85 
 
 
165 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536876  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  54.41 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>