More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2680 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2680  IS1 transposase  100 
 
 
219 aa  442  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364824  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3611  IS1 transposase  94.95 
 
 
219 aa  421  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.533589  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3693  IS1 transposase  74.55 
 
 
229 aa  310  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00714444  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3609  insertion element protein  96.4 
 
 
112 aa  217  8.999999999999998e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.021935  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2872  insertion element protein  32.29 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0170965  normal  0.0593155 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3170  insertion element protein  31.84 
 
 
232 aa  125  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0270  insertion element protein  31.39 
 
 
232 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0855  insertion element protein  31.39 
 
 
232 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0978  insertion element protein  31.39 
 
 
232 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1570  insertion element protein  31.39 
 
 
232 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54283  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1612  insertion element protein  31.39 
 
 
232 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1816  insertion element protein  31.39 
 
 
232 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.495778 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2200  insertion element protein  31.39 
 
 
232 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209306  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2454  insertion element protein  31.39 
 
 
232 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875494  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2714  insertion element protein  31.39 
 
 
232 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2883  insertion element protein  31.39 
 
 
232 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00013028  normal  0.0546907 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3632  insertion element protein  31.39 
 
 
232 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00026173  normal  0.763989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3881  insertion element protein  31.39 
 
 
232 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.719771  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3346  insertion element protein  30.94 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3893  insertion element protein  30.94 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3171  insertion element protein  30.94 
 
 
232 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.22651  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3185  insertion element protein  30.94 
 
 
232 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1208  Insertion element protein  27.48 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2516  Insertion element protein  27.48 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5744  Insertion element protein  26.24 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5203  Insertion element protein  26.24 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.32414e-16 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1282  hypothetical protein  30.09 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.147324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00024  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00213822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00504  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00545  IS1 protein insB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.160638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01244  IS1 protein InsA  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01373  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01881  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000653204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02143  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02102  hypothetical protein  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00509  hypothetical protein  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.584705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04286  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.448136  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2372  IS1 transposase  35.48 
 
 
148 aa  77.8  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.698246  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2383  IS1 transposase  35.48 
 
 
148 aa  77.8  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.597317  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2433  IS1 transposase  35.48 
 
 
148 aa  77.8  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2007  IS1 transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01253  hypothetical protein  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0614  IS1 transposase  35.48 
 
 
148 aa  77.8  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261019  normal  0.286378 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00534  hypothetical protein  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2996  IS1 transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.217077 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00025  hypothetical protein  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01871  hypothetical protein  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000392392  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04179  hypothetical protein  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01385  hypothetical protein  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3316  IS1, transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0086  IS1 transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0718475  hitchhiker  0.0000000542412 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00211  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00237  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00313  IS1 protein InsB  35.83 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00340  IS1 protein InsB  35.83 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00571  IS1 protein InsB  35.83 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00587  IS1 protein InsB  35.83 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01117  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01934  IS1 protein InsB  35.83 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02040  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02452  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02514  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02646  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02823  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000374053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03484  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04163  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.636696  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04180  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04209  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04281  IS1 protein InsB  36.67 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4691  hypothetical protein  36.67 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000333815  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2377  IS1 transposase  34.68 
 
 
148 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2446  IS1 transposase  34.68 
 
 
148 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.994659  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2533  IS1 transposase  34.68 
 
 
148 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2578  IS1 transposase  34.68 
 
 
148 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2595  IS1 transposase  34.68 
 
 
148 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00695571  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2700  IS1 transposase  34.68 
 
 
148 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179766  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2795  IS1 transposase  34.68 
 
 
148 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0430  IS1 transposase  34.68 
 
 
148 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.356637 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0805  IS1 transposase  34.68 
 
 
148 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.244962  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1030  IS1 transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.871892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0739  IS1, transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00024765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0780  IS1, transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1140  IS1, transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0049533  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1163  IS1, transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.452867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1386  IS1, transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1530  IS1, transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1651  IS1, transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000315416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1779  IS1, transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2416  IS1, transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0295227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2650  IS1, transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0337075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2761  IS1, transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000020143  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3145  IS1, transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3240  IS1, transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.035564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3688  IS1, transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2936  IS1 transposase  34.68 
 
 
148 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2987  IS1 transposase  34.68 
 
 
148 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3100  IS1 transposase  34.68 
 
 
148 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0068  IS1 transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518742 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0074  IS1 transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010878 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0104  IS1 transposase orfB  36.67 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00262405  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>