33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_R0017 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_R0017  tRNA-Met  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0898  tRNA-Met  90.41 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.542137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0029  tRNA-Met  85.92 
 
 
77 bp  54  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00945673 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Met-2  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0014  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000138583  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.617808  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0069  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0826408  hitchhiker  0.0022549 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0058  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00611811  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0047  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10564  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0046  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00480541  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0054  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000352314  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0044  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0237492  normal  0.0570511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0063  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000469016  normal  0.343249 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0003  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000155812  hitchhiker  0.0000000064789 
 
 
-
 
NC_003295  RS00235  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00686486  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0003  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000227262  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05381  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0141064  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0473  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0076  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179177  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0071  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00796346  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0063  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517166  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0053  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349668  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS05583  tRNA-Ala  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00137885  normal  0.131541 
 
 
-
 
NC_003295  RS05732  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705135  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0079  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897328  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0071  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00351274  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0062  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0202562  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0052  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>